RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 NEPROQ6NW34 567 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBA3EQ6PEY2 450 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 XKRXQ6PP77 449 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 GSTA5Q7RTV2 222 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD37Q7Z713 158 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 PRELID2Q8N945 189 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 MDS2Q8NDY4 140 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 OR51Q1Q8NH59 317 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ASB11Q8WXH4 323 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF354BQ96LW1 612 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 NPAS2Q99743 824 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD10Q9NXR5 420 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 MAN1A2O60476 641 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CYC1P08574 325 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 IL1RNP18510 177 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 IMPA1P29218 277 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 XCR1P46094 333 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TERF1P54274 439 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TTLL9Q3SXZ7 439 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 MEI1Q5TIA1 1274 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CRLF3Q8IUI8 442 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR137Q96N19 417 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL1Q9NR64 748 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 GUCA1BQ9UMX6 200 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM227AF5H4B4 570 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 C19orf84I3L1E1 186 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 GFYI3L273 518 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 SGK494L7N484 410 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 MPC1LP0DKB6 136 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK16Q00536 496 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 PTK6Q13882 451 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS6KA1Q15418 735 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF470Q6ECI4 717 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF549Q6P9A3 640 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CYHR1Q6ZMK1 362 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGED4Q96JG8 741 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNK13Q9HB14 408 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF835Q9Y2P0 537 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TTI1O43156 1089 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CD96P40200 585 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 BCL6P41182 706 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1C1Q15619 314 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 DENND6AQ8IWF6 608 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 SCMH1Q96GD3 660 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TSGA10Q9BZW7 698 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM184CQ9NVA4 438 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 SH2B3Q9UQQ2 575 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 PAMP19021 973 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 AGAP20933 346 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 AGTR2P50052 363 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 RIPPLY3P57055 190 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TBPL1P62380 186 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 MEP1AQ16819 746 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 SPINK14Q6IE38 97 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 PDSS2Q86YH6 399 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 MCOLN3Q8TDD5 553 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNJ9Q92806 393 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC138Q96M89 665 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 FRMD6Q96NE9 622 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL42Q9P2K6 505 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CTAGE9A4FU28 777 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ASPDHA6ND91 283 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 NPIPA5E9PKD4 350 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB14O43829 449 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF5CO60282 957 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 SMSP52788 366 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CSNK1G2P78368 415 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CTBP1Q13363 440 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 EXT1Q16394 746 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CASC4Q6P4E1 433 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 SPPL2CQ8IUH8 684 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 KCT2Q8NC54 265 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 M1APQ8TC57 530 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CD200R1Q8TD46 325 aa24.16■■□□□ 1.46
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