RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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CAPNS1-205ENST00000588780 OR51Q1Q8NH59 317 aa20.5■□□□□ 0.87
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CAPNS1-205ENST00000588780 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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CAPNS1-205ENST00000588780 BIVMQ86UB2 503 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-205ENST00000588780 SHISA5Q8N114 240 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-205ENST00000588780 KIF2BQ8N4N8 673 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-205ENST00000588780 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
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CAPNS1-205ENST00000588780 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC6A16Q9GZN6 736 aa20.45■□□□□ 0.86
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