RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC138Q96M89 665 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ATOH8Q96SQ7 321 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PAFAH2Q99487 392 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 NUDT9Q9BW91 350 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CUTCQ9NTM9 273 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 GPR83Q9NYM4 423 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 COPG2Q9UBF2 871 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PLAAQ9Y263 795 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 LRRK2Q5S007 2527 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 SVILO95425 2214 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A0J9YVX5 310 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 HYKKA2RU49 373 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 TTLL8A6PVC2 850 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CDC7O00311 574 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PEX12O00623 359 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ZBTB14O43829 449 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 NRP2O60462 931 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 DPM1O60762 260 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 IGHEP01854 428 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ALBP02768 609 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 COL6A2P12110 1019 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CMPK1P30085 196 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CD97P48960 835 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PNLIPRP1P54315 467 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ABATP80404 500 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 RAPSNQ13702 412 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 NAA25Q14CX7 972 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 NKG7Q16617 165 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 DCAF10Q5QP82 559 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 SUSD1Q6UWL2 747 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 COX15Q7KZN9 410 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 LCA5Q86VQ0 697 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 HPS6Q86YV9 775 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 OR4N4Q8N0Y3 316 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 GALNT16Q8N428 558 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 NACC2Q96BF6 587 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 OR4K3Q96R72 315 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 SPSB2Q99619 263 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 DPH7Q9BTV6 452 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PARD6BQ9BYG5 372 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC26A1Q9H2B4 701 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 WDR54Q9H977 334 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CAB39LQ9H9S4 337 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 GPAMQ9HCL2 828 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
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EFTUD2-210ENST00000588340 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 C5AR2Q9P296 337 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 OARD1Q9Y530 152 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A087X1B8 175 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF839A8K0R7 811 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 H0YGG7 62 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 AGPSO00116 658 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 MASP2O00187 686 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 KERAO60938 352 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 KRT38O76015 456 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 KLHL2O95198 593 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 MED26O95402 600 aa6.53□□□□□ -1.36
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