RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579815.1

CLTC-211, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 5

Gene CLTC, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-211ENST00000579815 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.13□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 GALPQ9UBC7 116 aa6.13□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.13□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.13□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 LZTS1Q9Y250 596 aa6.13□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 TMED5Q9Y3A6 229 aa6.13□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 TRIM17Q9Y577 477 aa6.13□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 TIMM22Q9Y584 194 aa6.13□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.13□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa6.13□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 ENO4A6NNW6 628 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 LEFTY2O00292 366 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 ANKRD28O15084 1053 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 TEX28O15482 410 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 UGDHO60701 494 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 PLXNA2O75051 1894 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 TIPRLO75663 272 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 AP2A2O94973 939 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 RASAL1O95294 804 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 H6PDO95479 791 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 HPRP00739 348 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 KRT6AP02538 564 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 KRT6BP04259 564 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 CLTBP09497 229 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 ALPIP09923 528 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 PRPS2P11908 318 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 SRCP12931 536 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 ARSAP15289 507 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 ZNF23P17027 643 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 MYF6P23409 242 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 AKT1P31749 480 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 PEX19P40855 299 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 GNPDA1P46926 289 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 KRT6CP48668 564 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 CCT8P50990 548 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 POLE2P56282 527 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 AP1S2P56377 157 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 UFM1P61960 85 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 ECT2LQ008S8 904 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 TLE2Q04725 743 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 LIPEQ05469 1076 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 EPS8Q12929 822 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 CHRNA6Q15825 494 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 CYP51A1Q16850 503 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 IMPG1Q17R60 797 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 AP5B1Q2VPB7 878 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 MYLK3Q32MK0 819 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 TM4SF20Q53R12 229 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 PAGE3Q5JUK9 113 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 C6orf52Q5T4I8 152 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 TXNDC8Q6A555 127 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 APCDD1Q8J025 514 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 SFRP1Q8N474 314 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 TERB1Q8NA31 727 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 OR52B6Q8NGF0 335 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 STARD8Q92502 1023 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 TFAP2CQ92754 450 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 USP7Q93009 1102 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 TIFAQ96CG3 184 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 EID2BQ96D98 161 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 OTUB2Q96DC9 234 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 DTNBP1Q96EV8 351 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 LMLNQ96KR4 655 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 SLC22A12Q96S37 553 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 CGREF1Q99674 301 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 SH3GL3Q99963 347 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 SLC32A1Q9H598 525 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 ASAH2Q9NR71 780 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 GIMAP2Q9UG22 337 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 ZNF639Q9UID6 485 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 SNX6Q9UNH7 406 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 AURKCQ9UQB9 309 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.12□□□□□ -1.43
CLTC-211ENST00000579815 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms