RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MYZAPP0CAP1 466 aa31.61■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCTRP47872 440 aa31.61■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP1A2P50993 1020 aa31.61■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHIT1Q13231 466 aa31.61■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLN3Q13286 438 aa31.61■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 E2F2Q14209 437 aa31.61■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRTGQ2VWP7 1150 aa31.61■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM214AQ32MH5 1076 aa31.61■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa31.61■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa31.61■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa31.61■■■□□ 2.65
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CTDNEP1-209ENST00000574205 HERVK_113P63132 956 aa31.6■■■□□ 2.65
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP31.6■■■□□ 2.65
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MID2Q9UJV3 735 aa31.6■■■□□ 2.65
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CTDNEP1-209ENST00000574205 G3V2L1 256 aa31.59■■■□□ 2.65
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MYL2P10916 166 aa31.59■■■□□ 2.65
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CTDNEP1-209ENST00000574205 EMP3P54852 163 aa31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 HKDC1Q2TB90 917 aa31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAGE2BQ5JRK9 111 aa31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZYG11AQ6WRX3 759 aa31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 DSELQ8IZU8 1212 aa31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL22RA1Q8N6P7 574 aa31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZBTB9Q96C00 473 aa31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 TM4SF19Q96DZ7 209 aa31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 IPPKQ9H8X2 491 aa31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 LHX9Q9NQ69 397 aa31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 CUTCQ9NTM9 273 aa31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa31.59■■■□□ 2.65
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CTDNEP1-209ENST00000574205 EXOC3L1Q86VI1 746 aa31.59■■■□□ 2.65
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NT5DC2Q9H857 520 aa31.59■■■□□ 2.65
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CD22P20273 847 aa31.57■■■□□ 2.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 IMPDH1P20839 514 aa31.57■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MANEAQ5SRI9 462 aa31.57■■■□□ 2.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTLL10Q6ZVT0 673 aa31.57■■■□□ 2.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 HDXQ7Z353 690 aa31.57■■■□□ 2.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCP10LQ8TDR4 215 aa31.57■■■□□ 2.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACTR8Q9H981 624 aa31.57■■■□□ 2.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GX78 115 aa31.56■■■□□ 2.64
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