RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	SYT16	Q17RD7	645 aa		20.66	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	20.66	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	20.66	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		20.66	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		20.66	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		20.66	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	20.66	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		20.66	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	SARG	Q9BW04	601 aa		20.66	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		20.66	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		20.66	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		20.66	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		20.66	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	LUZP4	Q9P127	313 aa		20.66	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	ESPL1	Q14674	2120 aa		20.66	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		20.66	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	IDS	B3KWA1	339 aa		20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	PIAS1	O75925	651 aa		20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	ANXA5	P08758	320 aa		20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	ACPP	P15309	386 aa		20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	SSTR1	P30872	391 aa		20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF460	Q14592	562 aa		20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFA9	Q16795	377 aa		20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	ATCAY	Q86WG3	371 aa		20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP97	Q8IW35	865 aa		20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	ATL1	Q8WXF7	558 aa		20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	C8orf44	Q96CB5	159 aa		20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	VPS50	Q96JG6	964 aa		20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	MAST4	O15021	2626 aa		20.65	■□□□□ 0.9
PPP4C-205	ENST00000563200		H0YIG0	161 aa		20.64	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	20.64	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	GUCA1C	O95843	209 aa		20.64	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	HP	P00738	406 aa		20.64	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	C1QA	P02745	245 aa		20.64	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	COX6A1	P12074	109 aa		20.64	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	SAT1	P21673	171 aa		20.64	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	EMP2	P54851	167 aa		20.64	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	20.64	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		20.64	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	CYS1	Q717R9	158 aa		20.64	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		20.64	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	20.64	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		20.64	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	SHISA5	Q8N114	240 aa		20.64	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		20.64	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		20.64	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	VPS39	Q96JC1	886 aa		20.64	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		20.64	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	20.63	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC7	O00311	574 aa		20.63	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	AVPR1B	P47901	424 aa		20.63	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	CCR8	P51685	355 aa		20.63	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZS92	163 aa		20.63	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		20.63	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	ASPG	Q86U10	573 aa		20.63	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	KCT2	Q8NC54	265 aa		20.63	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		20.63	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	TM9SF4	Q92544	642 aa		20.63	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		20.63	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	LHPP	Q9H008	270 aa		20.63	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		20.63	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		20.63	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		20.62	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		20.62	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP2K7	O14733	419 aa		20.62	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDH17	O14917	1159 aa		20.62	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	BMP10	O95393	424 aa		20.62	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	GRK3	P35626	688 aa		20.62	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	UQCRFS1	P47985	274 aa		20.62	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	20.62	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	20.62	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		20.62	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		20.62	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM205	Q6UW68	189 aa		20.62	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		20.62	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		20.62	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	NEIL2	Q969S2	332 aa		20.62	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	AGAP4	Q96P64	663 aa		20.62	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		20.62	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		20.61	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	20.61	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		20.61	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM159B	A6NKW6	160 aa		20.61	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	VPS4B	O75351	444 aa		20.61	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	HEXB	P07686	556 aa		20.61	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	IL1RN	P18510	177 aa		20.61	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	GPX6	P59796	221 aa		20.61	■□□□□ 0.89
PPP4C-205	ENST00000563200	CDKL1	Q00532	357 aa		20.61	■□□□□ 0.89

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