RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557644.5

NEDD1-213, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD1, Length 2,367 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-213ENST00000557644 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 OR4F21O95013 312 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 MLYCDO95822 493 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 NEFHP12036 1026 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 TSPAN7P41732 249 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 ATP1A2P50993 1020 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 LSMEM2Q8N112 164 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 ZNF382Q96SR6 550 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 SARGQ9BW04 601 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 MID1IP1Q9NPA3 183 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 FFAR3O14843 346 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 GPR42O15529 346 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 P2RX6O15547 441 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 TNFSF15O95150 251 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 SCTRP47872 440 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 RELAQ04206 551 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 ASPHQ12797 758 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 HKDC1Q2TB90 917 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 LIPJQ5W064 366 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 RNF175Q8N4F7 328 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 AGAP11Q8TF27 550 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 KCNA7Q96RP8 456 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 C20orf27Q9GZN8 174 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 IRAK4Q9NWZ3 460 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 RARRES3Q9UL19 164 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 ITM2AO43736 263 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 UGDHO60701 494 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 OR2B3O76000 313 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 ADRB1P08588 477 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 FOXA1P55317 472 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 GPS2Q13227 327 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 VN1R5Q7Z5H4 357 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 PPP1R3BQ86XI6 285 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 KRT78Q8N1N4 520 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 CDYL2Q8N8U2 506 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 MFSD9Q8NBP5 474 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 USP7Q93009 1102 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 CNDP1Q96KN2 507 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 FANCEQ9HB96 536 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 C9orf172C9J069 976 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 NPHS1O60500 1241 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 SERPINE1P05121 402 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 SERPIND1P05546 499 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 CXCR2P25025 360 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 HNF4AP41235 474 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 ITGA1P56199 1179 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 RCN2Q14257 317 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 IL11RAQ14626 422 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 CSNK1A1LQ8N752 337 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 OR7G3Q8NG95 312 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 DRC3Q9H069 523 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 SERTAD3Q9UJW9 196 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 TRABD2BA6NFA1 517 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 NDUFS4O43181 175 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 ESRRBO95718 433 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 PCNAP12004 261 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 FGF5P12034 268 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 NEK2P51955 445 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 LAPTM5Q13571 262 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 MED27Q6P2C8 311 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 DTWD1Q8N5C7 304 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 AGR3Q8TD06 166 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 SLC46A1Q96NT5 459 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 TAAR9Q96RI9 348 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 FOXJ2Q9P0K8 574 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 TIMM22Q9Y584 194 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-213ENST00000557644 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms