RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556718.1

PRPF39-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF39, Length 499 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-210ENST00000556718 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
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PRPF39-210ENST00000556718 DENND3A2RUS2 1198 aa3.95□□□□□ -1.78
PRPF39-210ENST00000556718 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa3.95□□□□□ -1.78
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PRPF39-210ENST00000556718 REC8O95072 547 aa3.93□□□□□ -1.78
PRPF39-210ENST00000556718 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PRPF39-210ENST00000556718 IGLV2-11P01706 119 aa3.93□□□□□ -1.78
PRPF39-210ENST00000556718 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PRPF39-210ENST00000556718 ALPPP05187 535 aa3.93□□□□□ -1.78
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PRPF39-210ENST00000556718 ABHD2P08910 425 aa3.93□□□□□ -1.78
PRPF39-210ENST00000556718 IGHV4-31P0DP07 118 aa3.93□□□□□ -1.78
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