RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	IRGC	Q6NXR0	463 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	NAGS	Q8N159	534 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	OR10G6	Q8NH81	332 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CPT1B	Q92523	772 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	C12orf66	Q96MD2	445 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	VPS35	Q96QK1	796 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	STRADB	Q9C0K7	418 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	IL22	Q9GZX6	179 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	RNF14	Q9UBS8	474 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	MGAT4D	A6NG13	374 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	IQCF5	A8MTL0	148 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288		E5RI56	91 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CHUK	O15111	745 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	AKAP10	O43572	662 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNJ13	O60928	360 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TNFSF15	O95150	251 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CPNE6	O95741	557 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	FTH1	P02794	183 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	PROS1	P07225	676 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	GP1BA	P07359	652 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR89B	P0CG08	455 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	HGF	P14210	728 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SAT1	P21673	171 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CD1C	P29017	333 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	NSG1	P42857	185 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	FNTA	P49354	379 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TTPA	P49638	278 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	ITGA8	P53708	1063 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	INHBC	P55103	352 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	ARL4C	P56559	192 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CTXN1	P60606	82 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	DGCR2	P98153	550 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	NHLH2	Q02577	135 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	FOXM1	Q08050	763 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CALCOCO2	Q13137	446 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CTBP1	Q13363	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	PTK6	Q13882	451 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNJ11	Q14654	390 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	RPE65	Q16518	533 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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