RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	ABAT	P80404	500 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	TUBA3C	Q13748	450 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	CCNG2	Q16589	344 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	LONRF1	Q17RB8	773 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	BTBD16	Q32M84	506 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ACER2	Q5QJU3	275 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	XKRX	Q6PP77	449 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	MDS2	Q8NDY4	140 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	KLHL1	Q9NR64	748 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	MED16	Q9Y2X0	877 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	DNAJC13	O75165	2243 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF839	A8K0R7	811 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM227A	F5H4B4	570 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931		H0YIG0	161 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNHIT1	O43257	154 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	AVIL	O75366	819 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	IMPA1	P29218	277 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	XCR1	P46094	333 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	KCNJ1	P48048	391 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	TERF1	P54274	439 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	RIPPLY3	P57055	190 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	NDUFA9	Q16795	377 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	PRELID2	Q8N945	189 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ASB11	Q8WXH4	323 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	GPR137	Q96N19	417 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	KCNK13	Q9HB14	408 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	GFY	I3L273	518 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	SGK494	L7N484	410 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	AP3B1	O00203	1094 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	PFDN6	O15212	129 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	CYC1	P08574	325 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	MYBL2	P10244	700 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	TPSB2	P20231	275 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	CD96	P40200	585 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	CASP6	P55212	293 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP10-9	P60411	292 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	OR1C1	Q15619	314 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	TPSAB1	Q15661	275 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	SPINK14	Q6IE38	97 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	NEPRO	Q6NW34	567 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	PDSS2	Q86YH6	399 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	SCMH1	Q96GD3	660 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	MAGED4	Q96JG8	741 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC138	Q96M89	665 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	FRMD6	Q96NE9	622 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	RBSN	Q9H1K0	784 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ASPDH	A6ND91	283 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	TTI1	O43156	1089 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	RDH16	O75452	317 aa		11.85	□□□□□ -0.51

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