RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 C2CD4DB7Z1M9 353 aa20.15■□□□□ 0.82
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PRDM4-205ENST00000550376 LINC01555Q8NAE3 123 aa20.15■□□□□ 0.82
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PRDM4-205ENST00000550376 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
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PRDM4-205ENST00000550376 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
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PRDM4-205ENST00000550376 IDSP22304 550 aa20.12■□□□□ 0.81
PRDM4-205ENST00000550376 CHN2P52757 468 aa20.12■□□□□ 0.81
PRDM4-205ENST00000550376 POLE2P56282 527 aa20.12■□□□□ 0.81
PRDM4-205ENST00000550376 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PRDM4-205ENST00000550376 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PRDM4-205ENST00000550376 C17orf64Q86WR6 236 aa20.12■□□□□ 0.81
PRDM4-205ENST00000550376 MICU2Q8IYU8 434 aa20.12■□□□□ 0.81
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