RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549306.1

HECTD4-210, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-210ENST00000549306 PRDM1O75626 825 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 DEXIO95424 95 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 YEATS4O95619 227 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 TMOD1P28289 359 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 RAD52P43351 418 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 LIMK1P53667 647 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 UBE2HP62256 183 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 CDR2Q01850 454 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 GBE1Q04446 702 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 CCDC173Q0VFZ6 552 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 BNIP1Q12981 228 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 MFAP5Q13361 173 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 DRP2Q13474 957 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 KCNC3Q14003 757 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 COG2Q14746 738 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 TNIP1Q15025 636 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 P2RY6Q15077 328 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 BOLA3Q53S33 107 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 FAM180BQ6P0A1 224 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 SASS6Q6UVJ0 657 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 TMTC3Q6ZXV5 915 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 RAPH1Q70E73 1250 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 CCDC186Q7Z3E2 898 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 ZER1Q7Z7L7 766 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 HOOK3Q86VS8 718 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 HPS6Q86YV9 775 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 RAB42Q8N4Z0 105 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF383Q8NA42 475 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 SPC24Q8NBT2 197 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 KIAA1524Q8TCG1 905 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 ACMSDQ8TDX5 336 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 TEKT4Q8WW24 435 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 SMPDL3BQ92485 455 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 SUSD6Q92537 303 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 CEP295NLQ96MC4 621 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 SPZ1Q9BXG8 430 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 GLT8D2Q9H1C3 349 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 VCX3BQ9H321 246 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 SYNCQ9H7C4 482 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 ANKEF1Q9NU02 776 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 EPS15L1Q9UBC2 864 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 GIMAP2Q9UG22 337 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 HAO1Q9UJM8 370 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 CCPG1Q9ULG6 757 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 PRELID1Q9Y255 219 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 MYH15Q9Y2K3 1946 aa3.4□□□□□ -1.86
HECTD4-210ENST00000549306 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 ESYT2A0FGR8 921 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 TMEM221A6NGB7 291 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 P4HA2O15460 535 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 TMCC2O75069 709 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 ERLIN1O75477 346 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 GFPT2O94808 682 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 KCNK5O95279 499 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 STAMBPO95630 424 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 OLFM2O95897 454 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 MMP1P03956 469 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 TSPY3P0CV98 308 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 TSPY8P0CW00 308 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 TOP1P11387 765 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 KRT13P13646 458 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 CAPN3P20807 821 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 CDH11P55287 796 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 CD81P60033 236 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 TSPY1Q01534 308 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 TFAP4Q01664 338 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 CXCL9Q07325 125 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 LRRC74AQ0VAA2 488 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 CAMK1Q14012 370 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 GSTA3Q16772 222 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 METTL11BQ5VVY1 283 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 MZT2BQ6NZ67 158 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 TATDN1Q6P1N9 297 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 FAM173BQ6P4H8 233 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 IL27RAQ6UWB1 636 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 NLRP14Q86W24 1093 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 CEP57L1Q8IYX8 460 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 LSMEM1Q8N8F7 131 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 SMYD1Q8NB12 490 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF540Q8NDQ6 660 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 SPATA18Q8TC71 538 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 HM13Q8TCT9 377 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 ZFAND2BQ8WV99 257 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 DYNLL2Q96FJ2 89 aa3.4□□□□□ -1.87
HECTD4-210ENST00000549306 CFAP36Q96G28 342 aa3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms