RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 ARNT2Q9HBZ2 717 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF358Q9NW07 568 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM248Q9NWD8 314 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 ERVW-1Q9UQF0 538 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 MAU2Q9Y6X3 613 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 E9PI62 339 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 MITFO75030 526 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 CCNDBP1O95273 360 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 LATS1O95835 1130 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 TSPAN8P19075 237 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 TBX4P57082 545 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 TSPAN5P62079 268 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 GRM2Q14416 872 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 FAM182AQ5T1J6 154 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 PIK3R6Q5UE93 754 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 VN1R5Q7Z5H4 357 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 TSPAN33Q86UF1 283 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 SLC38A6Q8IZM9 456 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 SLC47A1Q96FL8 570 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 SLC41A3Q96GZ6 507 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF350Q9GZX5 532 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 GLTPQ9NZD2 209 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 MYADML2A6NDP7 307 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 PLIN3O60664 434 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 NDUFS3O75489 264 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 CSH1P0DML2 217 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 CSH2P0DML3 217 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 HLA-EP13747 358 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 RPS2P15880 293 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 YWHAQP27348 245 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 CD6P30203 668 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 PCP4P48539 62 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 PPP3R1P63098 170 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 RPP38P78345 283 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 PRKCZQ05513 592 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 CDNFQ49AH0 187 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 FAM205BPQ63HN1 556 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 CGB2Q6NT52 195 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 PKN3Q6P5Z2 889 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 KCNMB4Q86W47 210 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 LSMEM1Q8N8F7 131 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 RAET1EQ8TD07 263 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 ZFP90Q8TF47 636 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 UBE2E3Q969T4 207 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 SGTBQ96EQ0 304 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 ZDHHC12Q96GR4 267 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 SLC39A13Q96H72 371 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 LPIN3Q9BQK8 851 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 RTP3Q9BQQ7 232 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 MCMBPQ9BTE3 642 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 MID1IP1Q9NPA3 183 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 UFSP2Q9NUQ7 469 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 WWOXQ9NZC7 414 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 INVSQ9Y283 1065 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 NUMBLQ9Y6R0 609 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 THSD7BQ9C0I4 1608 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 C9JVG2 144 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 HEXBP07686 556 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 BMP2P12643 396 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 S100PP25815 95 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 ETV5P41161 510 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 ALDH3A2P51648 485 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 ARHGDIBP52566 201 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 MEP1AQ16819 746 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 ANXA8L1Q5VT79 327 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 CYB5R2Q6BCY4 276 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 BHLHA9Q7RTU4 235 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 CADM3Q8N126 398 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 FNDC5Q8NAU1 212 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 HEXDCQ8WVB3 486 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 HDAC10Q969S8 669 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 MYO19Q96H55 970 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 OMDQ99983 421 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 C19orf43Q9BQ61 176 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 IFT46Q9NQC8 304 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 TRPS1Q9UHF7 1281 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 ARVCFO00192 962 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 TNFRSF10BO14763 440 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 ACOX3O15254 700 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 EPOP01588 193 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 MBP02144 154 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 AMHP03971 560 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 MYF6P23409 242 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 RFC2P35250 354 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 SOAT1P35610 550 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 CASP3P42574 277 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 DPP6P42658 865 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms