RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	FCRLA	Q7L513	359 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	RNF130	Q86XS8	419 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	LPGAT1	Q92604	370 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	SLAMF9	Q96A28	289 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	PTER	Q96BW5	349 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	ABHD1	Q96SE0	405 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	CENPO	Q9BU64	300 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	APOL6	Q9BWW8	343 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	SWAP70	Q9UH65	585 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	RNF150	Q9ULK6	438 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268		A0A1W2PPE2	198 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268		A0A1W2PPQ1	181 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268		A0A1W2PR64	198 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	FAM168B	A1KXE4	195 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	GLOD5	A6NK44	160 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268		O00370	1275 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	HAT1	O14929	419 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	SURF4	O15260	269 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	OGT	O15294	1046 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	FIBP	O43427	364 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	VENTX	O95231	258 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	PGM3	O95394	542 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	AKR1B1	P15121	316 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	EDNRA	P25101	427 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	CHRNA3	P32297	505 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	LIG4	P49917	911 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	SGCG	Q13326	291 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	LEMD1	Q68G75	181 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	TMEM64	Q6YI46	380 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	BRINP3	Q76B58	766 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	AVL9	Q8NBF6	648 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	AGAP11	Q8TF27	550 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	NXNL1	Q96CM4	212 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	B3GALT6	Q96L58	329 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	GCNA	Q96QF7	691 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	MGME1	Q9BQP7	344 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		2.54	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268		A0A1W2PPK0	400 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	MTMR11	A4FU01	709 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	ADAM20	O43506	726 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	BAG3	O95817	575 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	LY6G6D	O95868	133 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	IRF2	P14316	349 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	RAD52	P43351	418 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	GSK3B	P49841	420 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	NDST2	P52849	883 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	DCDC1	P59894	354 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	ITPK1	Q13572	414 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	BECN1	Q14457	450 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	SNAPC1	Q16533	368 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	OR4A47	Q6IF82	309 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	TMCO6	Q96DC7	493 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		2.53	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		2.52	□□□□□ -2.01
USP34-222	ENST00000498268	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		2.52	□□□□□ -2.01
USP34-222	ENST00000498268	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		2.52	□□□□□ -2.01
USP34-222	ENST00000498268	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
USP34-222	ENST00000498268	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
USP34-222	ENST00000498268	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
USP34-222	ENST00000498268	KRT20	P35900	424 aa		2.52	□□□□□ -2.01
USP34-222	ENST00000498268	CCR3	P51677	355 aa		2.52	□□□□□ -2.01

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