RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	UBASH3A	P57075	661 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CSNK1G2	P78368	415 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	MUM1	Q2TAK8	710 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	EID3	Q8N140	333 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM13C	Q8NE31	585 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	GBP4	Q96PP9	640 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF32	Q9H0A6	362 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	NENF	Q9UMX5	172 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	MEMO1	Q9Y316	297 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	TACC2	O95359	2948 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	FITM1	A5D6W6	292 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	FFAR3	O14843	346 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR42	O15529	346 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PSTPIP1	O43586	416 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CD8B	P10966	210 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	FUT4	P22083	530 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ITIH4	Q14624	930 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	POU6F1	Q14863	301 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CDSN	Q15517	529 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR137	Q96N19	417 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL1	Q9NR64	748 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PPT2	Q9UMR5	302 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	TARM1	B6A8C7	271 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511		H7C0S8	307 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PRRG2	O14669	202 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CTSV	O60911	334 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	HTR3B	O95264	441 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MBD3	O95983	291 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	GYPC	P04921	128 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	TPH1	P17752	444 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	TMED2	Q15363	201 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	AGAP11	Q8TF27	550 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	STYX	Q8WUJ0	223 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	10.26	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51F1	A6NGY5	319 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS26A	O75436	327 aa		10.25	□□□□□ -0.77

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