RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 FDCSPQ8NFU4 85 aa22.79■■□□□ 1.24
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SMKR1-201ENST00000462322 CRB3Q9BUF7 120 aa22.79■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM4Q9C037 500 aa22.79■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 MLXIPLQ9NP71 852 aa22.79■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 SEMA3GQ9NS98 782 aa22.79■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
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SMKR1-201ENST00000462322 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa22.78■■□□□ 1.24
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SMKR1-201ENST00000462322 HNMTP50135 292 aa22.78■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 RAB10P61026 200 aa22.78■■□□□ 1.24
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SMKR1-201ENST00000462322 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
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SMKR1-201ENST00000462322 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.78■■□□□ 1.24
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SMKR1-201ENST00000462322 TBC1D19Q8N5T2 526 aa22.78■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 MFSD9Q8NBP5 474 aa22.78■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 OR4K1Q8NGD4 311 aa22.78■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 SLC13A3Q8WWT9 602 aa22.78■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 IFT81Q8WYA0 676 aa22.78■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 NEIL2Q969S2 332 aa22.78■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 TSNARE1Q96NA8 513 aa22.78■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 NUDT9Q9BW91 350 aa22.78■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.78■■□□□ 1.24
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SMKR1-201ENST00000462322 FBXL4Q9UKA2 621 aa22.78■■□□□ 1.24
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SMKR1-201ENST00000462322 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa22.77■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 OR1F1O43749 312 aa22.77■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 SLC26A3P40879 764 aa22.77■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 CASRP41180 1078 aa22.77■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 ATP6V0D1P61421 351 aa22.77■■□□□ 1.24
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SMKR1-201ENST00000462322 C3orf18Q9UK00 162 aa22.77■■□□□ 1.24
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SMKR1-201ENST00000462322 PELI2Q9HAT8 420 aa22.75■■□□□ 1.23
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SMKR1-201ENST00000462322 NSA2O95478 260 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
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SMKR1-201ENST00000462322 GDF5P43026 501 aa22.74■■□□□ 1.23
SMKR1-201ENST00000462322 EMP2P54851 167 aa22.74■■□□□ 1.23
SMKR1-201ENST00000462322 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SMKR1-201ENST00000462322 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SMKR1-201ENST00000462322 OR4D1Q15615 310 aa22.74■■□□□ 1.23
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