RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 RNF44Q7L0R7 432 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 PRUNE1Q86TP1 453 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 CNGA4Q8IV77 575 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
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HOXD8-202ENST00000429017 COG1Q8WTW3 980 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC120Q96HB5 630 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 C20orf173Q96LM9 149 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 CARD6Q9BX69 1037 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.22□□□□□ -1.41
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HOXD8-202ENST00000429017 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa6.21□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PQ72 361 aa6.21□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 OR2A25A4D2G3 310 aa6.21□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.21□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.21□□□□□ -1.41
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HOXD8-202ENST00000429017 C19orf84I3L1E1 186 aa6.21□□□□□ -1.41
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HOXD8-202ENST00000429017 C1orf105O95561 183 aa6.21□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 WDPCPO95876 746 aa6.21□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ITGAMP11215 1152 aa6.21□□□□□ -1.41
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HOXD8-202ENST00000429017 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.21□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 PMP22Q01453 160 aa6.21□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 PCOLCEQ15113 449 aa6.21□□□□□ -1.41
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HOXD8-202ENST00000429017 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa6.21□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.21□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 AFTPHQ6ULP2 937 aa6.21□□□□□ -1.41
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HOXD8-202ENST00000429017 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.21□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.21□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 AMER3Q8N944 861 aa6.21□□□□□ -1.41
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HOXD8-202ENST00000429017 OR4L1Q8NH43 312 aa6.21□□□□□ -1.41
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HOXD8-202ENST00000429017 FERMT1Q9BQL6 677 aa6.21□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.21□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.21□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.21□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
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HOXD8-202ENST00000429017 F8P00451 2351 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 TRAV17A0A0B4J275 112 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 IDSB3KWA1 339 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 H0YGG7 62 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 CCL21O00585 134 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 FOXS1O43638 330 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 KDM1AO60341 852 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 KRT38O76015 456 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 SUN1O94901 812 aa6.21□□□□□ -1.42
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HOXD8-202ENST00000429017 ETS1P14921 441 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 HTR1EP28566 365 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 CA7P43166 264 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 CARSP49589 748 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 EMP2P54851 167 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 CDH17Q12864 832 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 HKDC1Q2TB90 917 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXD8-202ENST00000429017 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.21□□□□□ -1.42
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