RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 IMMP1LQ96LU5 166 aa19.87■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 PARVBQ9HBI1 364 aa19.87■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 OLAHQ9NV23 265 aa19.87■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa19.87■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 WFS1O76024 890 aa19.86■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 STSP08842 583 aa19.86■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 PER3P56645 1201 aa19.86■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 CSNK1G2P78368 415 aa19.86■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 FAAH2Q6GMR7 532 aa19.86■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 AGTRAPQ6RW13 159 aa19.86■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 LCTLQ6UWM7 567 aa19.86■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 PALM2Q8IXS6 379 aa19.86■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 MYO1HQ8N1T3 1032 aa19.86■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 SIRT6Q8N6T7 355 aa19.86■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 CAMKVQ8NCB2 501 aa19.86■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 OR9A4Q8NGU2 314 aa19.86■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 METTL21AQ8WXB1 218 aa19.86■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 SGPP1Q9BX95 441 aa19.86■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 VN1R1Q9GZP7 353 aa19.86■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 ITGAMP11215 1152 aa19.85■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 GABRB3P28472 473 aa19.85■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 DCTP40126 519 aa19.85■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 TDGF1P3P51864 188 aa19.85■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R7Q15435 360 aa19.85■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 C17orf64Q86WR6 236 aa19.85■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 SLC35F6Q8N357 371 aa19.85■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 NDNQ99608 321 aa19.85■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 SARGQ9BW04 601 aa19.85■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 SNX12Q9UMY4 172 aa19.85■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa19.85■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 CELA2AP08217 269 aa19.84■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 GRK3P35626 688 aa19.84■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 BCL6P41182 706 aa19.84■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 PLAG1Q6DJT9 500 aa19.84■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 PAQR3Q6TCH7 311 aa19.84■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS41Q7RTY9 318 aa19.84■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 ASPGQ86U10 573 aa19.84■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 LURAP1LQ8IV03 231 aa19.84■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 OR51Q1Q8NH59 317 aa19.84■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 NR4A3Q92570 626 aa19.84■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 CYTH2Q99418 400 aa19.84■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 HAUS8Q9BT25 410 aa19.84■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 TEKT2Q9UIF3 430 aa19.84■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 SH2B3Q9UQQ2 575 aa19.84■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 OSGIN2Q9Y236 505 aa19.84■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 SLC22A7Q9Y694 548 aa19.84■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 CELSR2Q9HCU4 2923 aa19.84■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GUH1 482 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 LRRTM2O43300 516 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 JRKO75564 520 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 TSPAN12O95859 305 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 AHSGP02765 367 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 SLC35G6P0C7Q6 338 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H2ADP20671 130 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 XCR1P46094 333 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 AGTR2P50052 363 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 CDKN2DP55273 166 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 AP1S2P56377 157 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 ABHD11Q8NFV4 315 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 LINGO1Q96FE5 620 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 CERS2Q96G23 380 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 TAAR6Q96RI8 345 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H2AJQ99878 128 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 H2AFJQ9BTM1 129 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 ANKHQ9HCJ1 492 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 PLA2G3Q9NZ20 509 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 ASIC3Q9UHC3 531 aa19.83■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa19.83■□□□□ 0.76
LIMS1-208ENST00000428064 OR5H15A6NDH6 313 aa19.82■□□□□ 0.76
LIMS1-208ENST00000428064 WDPCPO95876 746 aa19.82■□□□□ 0.76
LIMS1-208ENST00000428064 UQCRHP07919 91 aa19.82■□□□□ 0.76
LIMS1-208ENST00000428064 MYBL2P10244 700 aa19.82■□□□□ 0.76
LIMS1-208ENST00000428064 NPPBP16860 134 aa19.82■□□□□ 0.76
LIMS1-208ENST00000428064 IL1RNP18510 177 aa19.82■□□□□ 0.76
LIMS1-208ENST00000428064 IL10P22301 178 aa19.82■□□□□ 0.76
LIMS1-208ENST00000428064 NAE1Q13564 534 aa19.82■□□□□ 0.76
LIMS1-208ENST00000428064 PHKG1Q16816 387 aa19.82■□□□□ 0.76
LIMS1-208ENST00000428064 MSS51Q4VC12 460 aa19.82■□□□□ 0.76
LIMS1-208ENST00000428064 ABHD17BQ5VST6 288 aa19.82■□□□□ 0.76
LIMS1-208ENST00000428064 DUPD1Q68J44 220 aa19.82■□□□□ 0.76
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF787Q6DD87 383 aa19.82■□□□□ 0.76
LIMS1-208ENST00000428064 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
LIMS1-208ENST00000428064 H3F3CQ6NXT2 135 aa19.82■□□□□ 0.76
LIMS1-208ENST00000428064 MFSD9Q8NBP5 474 aa19.82■□□□□ 0.76
LIMS1-208ENST00000428064 OR4K1Q8NGD4 311 aa19.82■□□□□ 0.76
LIMS1-208ENST00000428064 SLC13A3Q8WWT9 602 aa19.82■□□□□ 0.76
LIMS1-208ENST00000428064 OR1F2PQ96R84 312 aa19.82■□□□□ 0.76
LIMS1-208ENST00000428064 ATG10Q9H0Y0 220 aa19.82■□□□□ 0.76
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