RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424143.5

C9orf3-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 1,605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-204ENST00000424143 RGS6P49758 472 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-204ENST00000424143 SGSHP51688 502 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-204ENST00000424143 HMGA2P52926 109 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-204ENST00000424143 SELENOWP63302 87 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-204ENST00000424143 IL1RL1Q01638 556 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-204ENST00000424143 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-204ENST00000424143 SYT12Q8IV01 421 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-204ENST00000424143 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-204ENST00000424143 C11orf65Q8NCR3 313 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-204ENST00000424143 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-204ENST00000424143 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-204ENST00000424143 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-204ENST00000424143 APOLD1Q96LR9 279 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-204ENST00000424143 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-204ENST00000424143 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-204ENST00000424143 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-204ENST00000424143 H2AFJQ9BTM1 129 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-204ENST00000424143 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-204ENST00000424143 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-204ENST00000424143 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-204ENST00000424143 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 UGT2B17O75795 530 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 GJB5O95377 273 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 DLGAP3O95886 979 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 OR56A5P0C7T3 313 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 ITGB6P18564 788 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 BCL2L1Q07817 233 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 SLC13A2Q13183 592 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 MAPK11Q15759 364 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 SYT16Q17RD7 645 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 PRSS36Q5K4E3 855 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 RNLSQ5VYX0 342 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 RETSATQ6NUM9 610 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 ZNF544Q6NX49 715 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 ZNF621Q6ZSS3 439 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 TPGS1Q6ZTW0 290 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 GDPD3Q7L5L3 318 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 ZNF605Q86T29 641 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 TMCO6Q96DC7 493 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 PCDH12Q9NPG4 1184 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 POLE4Q9NR33 117 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 RASSF1Q9NS23 344 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 MARCH5Q9NX47 278 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 AASSQ9UDR5 926 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 VPS51Q9UID3 782 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 NOD1Q9Y239 953 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 KIAA1671Q9BY89 1806 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 SLC35F4A4IF30 521 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 GLTPD2A6NH11 291 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 TNFRSF11BO00300 401 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 GPR39O43194 453 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 ASGR1P07306 291 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 ALPIP09923 528 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 ADORA3P0DMS8 318 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 CYP2A7P20853 494 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 CD72P21854 359 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 HNF1BP35680 557 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 PRIM2P49643 509 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 PNLIPRP1P54315 467 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 COPZ1P61923 177 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 IFITM2Q01629 132 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.062e-8■□□□□ 10.5
C9orf3-204ENST00000424143 LAPTM4AQ15012 233 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 PTPRRQ15256 657 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 MICAQ29983 383 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 DESI1Q6ICB0 168 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 FUT10Q6P4F1 479 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 RNF130Q86XS8 419 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 FAM217AQ8IXS0 508 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 WDR20Q8TBZ3 569 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 UBE2FQ969M7 185 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 ZNF226Q9NYT6 803 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 NDUFAF4Q9P032 175 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 VPS29Q9UBQ0 182 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-204ENST00000424143 ZBBXA8MT70 800 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms