RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM161AQ9NX61 479 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HS3ST2Q9Y278 367 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MYOFQ9NZM1 2061 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD34BA5PLL1 514 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CFAP99D6REC4 459 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DYRK3O43781 588 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKCAP17252 672 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GRK3P35626 688 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CPT1AP50416 773 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 INAQ16352 499 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PAGE2BQ5JRK9 111 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PERM1Q5SV97 790 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF783Q6ZMS7 281 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CLHC1Q8NHS4 586 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OR51E2Q9H255 320 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FRYLO94915 3013 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SUPT3HB4E1H0 165 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 G3V2T6 193 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 KLF4O43474 513 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 KATNA1O75449 491 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLCO2B1O94956 709 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAMEF1O95521 474 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PIPP12273 146 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HLA-EP13747 358 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CEBPBP17676 345 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GALK2Q01415 458 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FUT11Q495W5 492 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 C9orf131Q5VYM1 1079 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TCTN3Q6NUS6 607 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TUBA3EQ6PEY2 450 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CEACAM20Q6UY09 585 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD46Q86W74 232 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 REPS1Q96D71 796 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DCSTAMPQ9H295 470 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LRTM1Q9HBL6 345 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AMBNQ9NP70 447 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FFAR3O14843 346 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR42O15529 346 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SEPT4O43236 478 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LIMS3P0CW19 117 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LIMS4P0CW20 117 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PRPS2P11908 318 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ACRV1P26436 265 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TPTEP56180 551 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PTSQ03393 145 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF33BQ06732 778 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF846Q147U1 533 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR33Q49SQ1 333 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 C12orf73Q69YU5 71 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NRARPQ7Z6K4 114 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 C11orf96Q7Z7L8 435 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ELMOD1Q8N336 334 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TSSK3Q96PN8 268 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SYT17Q9BSW7 474 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RMND5AQ9H871 391 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 BAG5Q9UL15 447 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SH2B3Q9UQQ2 575 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DVL2O14641 736 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HAT1O14929 419 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 EOMESO95936 686 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LALBAP00709 142 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 BAK1Q16611 211 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF19Q2TAC6 998 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MPP7Q5T2T1 576 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LINGO4Q6UY18 593 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TPGS1Q6ZTW0 290 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINA9Q86WD7 417 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FIG4Q92562 907 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXJ1Q92949 421 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 EPYCQ99645 322 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TPT1P8Q9HAU6 139 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HMG20AQ9NP66 347 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LIMD1Q9UGP4 676 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa3.49□□□□□ -1.85
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