RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 GGT2P36268 569 aa11.92□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 HSPA7P48741 367 aa11.92□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 PSPHP78330 225 aa11.92□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 AANATQ16613 207 aa11.92□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 KIAA0319Q5VV43 1072 aa11.92□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 TEX261Q6UWH6 196 aa11.92□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 ANKS3Q6ZW76 656 aa11.92□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 BBS7Q8IWZ6 715 aa11.92□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 AP2M1Q96CW1 435 aa11.92□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 U3KQ87 197 aa11.92□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 COL1A2P08123 1366 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 TRIP11Q15643 1979 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 FAM220BPB1ANY3 271 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 ESR1P03372 595 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 PRSS56P0CW18 603 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 KDELR2P33947 212 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 PER3P56645 1201 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 TEKQ02763 1124 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 TNK1Q13470 666 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 KCTD2Q14681 263 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 SPHARQ15513 63 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 BCL2L15Q5TBC7 163 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 DENND1CQ8IV53 801 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 OTULINQ96BN8 352 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 HRASLS5Q96KN8 279 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 SLC25A51Q9H1U9 297 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 WASH6PQ9NQA3 447 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 LATS2Q9NRM7 1088 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 GABRDO14764 452 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 NBNO60934 754 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 F8A1P23610 371 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 BLVRAP53004 296 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 PTPN5P54829 565 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 HSF2Q03933 536 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 SCRN3Q0VDG4 424 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM65Q6PI78 240 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 LGI4Q8N135 537 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 BRD7Q9NPI1 651 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 IFT46Q9NQC8 304 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 HEBP1Q9NRV9 189 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 PSME4Q14997 1843 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 LCHNA4D1U4 455 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 HAS3O00219 553 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 RPS17P08708 135 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 STOMP27105 288 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 HOXD10P28358 340 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 ACLYP53396 1101 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 LRRC74AQ0VAA2 488 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 GTF2H2Q13888 395 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 GNA13Q14344 377 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM132BQ14DG7 1078 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 XKR7Q5GH72 579 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 SLC5A8Q8N695 610 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 AGBL3Q8NEM8 1001 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 C11orf16Q9NQ32 467 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 FZD9O00144 591 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 CLIC1O00299 241 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 OPN1SWP03999 348 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 TGFB3P10600 412 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 INSRRP14616 1297 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 HOXA9P31269 272 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 TPMTP51580 245 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 ERVFC1P60507 584 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 FCN2Q15485 313 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF79Q15937 498 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 IGSF11Q5DX21 431 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 ANKRD53Q8N9V6 530 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 INPP5KQ9BT40 448 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 RBCK1Q9BYM8 510 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 DERL2Q9GZP9 239 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 HCN3Q9P1Z3 774 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 M0R233 179 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 STX16O14662 325 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 NIPSNAP2O75323 286 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 ANXA3P12429 323 aa11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms