RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393203.2

PTGFRN-201, Transcript of prostaglandin F2 receptor inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGFRN, Length 6,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRN-201ENST00000393203 LRRC32Q14392 662 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM110CQ1W6H9 321 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 RAB6CQ53S08 254 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 AMZ2Q86W34 360 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM80Q96HE8 168 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 PHOX2BQ99453 314 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 RAB6CQ9H0N0 254 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 SUV39H2Q9H5I1 410 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 MPIP34949 423 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 SMSP52788 366 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 PNLIPRP1P54315 467 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CHAF1BQ13112 559 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CARD16Q5EG05 197 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF675Q8TD23 568 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 SIX4Q9UIU6 781 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 A0A0G2JPF8 293 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 GLOD5A6NK44 160 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 MEN1O00255 615 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 DFNA5O60443 496 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CLCN7P51798 805 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 TUBA1BP68363 451 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 TUBA1AQ71U36 451 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CEP97Q8IW35 865 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 DERL2Q9GZP9 239 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 GNG8Q9UK08 70 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 PRORSD1PA6NEY8 169 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 FNTBP49356 437 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 FBXO43Q4G163 708 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 RAB12Q6IQ22 244 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 NUS1Q96E22 293 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CENPMQ9NSP4 180 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ENTPD6O75354 484 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 LHCGRP22888 699 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CCR8P51685 355 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CDH11P55287 796 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 EIPR1Q53HC9 387 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 NUDT13Q86X67 352 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM145Q8NBT3 493 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 TAPBPLQ9BX59 468 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 NANSQ9NR45 359 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 MASP1P48740 699 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CD97P48960 835 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 NFE2L1Q14494 772 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CCL14Q16627 93 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 NDUFA9Q16795 377 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 LIPKQ5VXJ0 399 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 TUBA3EQ6PEY2 450 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CPA6Q8N4T0 437 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ENAMQ9NRM1 1142 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 A0A1W2PPK0 400 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ANKRD66B4E2M5 251 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CBLP22681 906 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 STC1P52823 247 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 GALNT2Q10471 571 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 RGMBQ6NW40 437 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 Q6ZVU0 165 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 YIPF7Q8N8F6 280 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 OR8S1Q8NH09 359 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 LMO3Q8TAP4 145 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 TM9SF3Q9HD45 589 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CD2P06729 351 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 BTN3A2P78410 334 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 PRKCDQ05655 676 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ST3GAL4Q11206 333 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 SMOQ99835 787 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 USP29Q9HBJ7 922 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 A0A0D9SEW6 157 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 OR3A3P47888 321 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 OR3A2P47893 321 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 S100A10P60903 97 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 SPIN4Q56A73 249 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 KIAA1191Q96A73 305 aa14.79□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 TSSK6Q9BXA6 273 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms