RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384536.1

RNU6-1241P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1241, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1241P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SGCGQ13326 291 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 BIRC3Q13489 604 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ABRAXAS2Q15018 415 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 EXT1Q16394 746 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 PCK2Q16822 640 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 FAM83EQ2M2I3 478 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ALDH1L2Q3SY69 923 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ARMCX4Q5H9R4 360 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ADALQ6DHV7 355 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 CCDC13Q8IYE1 715 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 CDK20Q8IZL9 346 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 NME8Q8N427 588 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 PPFIBP2Q8ND30 876 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 LINS1Q8NG48 757 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 VN1R17PQ8TDU5 208 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 JDP2Q8WYK2 163 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 HARBI1Q96MB7 349 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ZNF560Q96MR9 790 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 NUP62CLQ9H1M0 184 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SP140LQ9H930 580 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ZNF702PQ9H963 129 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 DPP3Q9NY33 737 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 COPG2Q9UBF2 871 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 PEMTQ9UBM1 199 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 GGA2Q9UJY4 613 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ZNF221Q9UK13 617 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 PILRAQ9UKJ1 303 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ERVW-1Q9UQF0 538 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 CPQQ9Y646 472 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TEX264Q9Y6I9 313 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TNXBP22105 4242 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 UTYO14607 1347 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 IGSF10Q6WRI0 2623 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SLC1A7O00341 560 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 MMP1P03956 469 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 RHOXF2BP0C7M4 288 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 HNF1AP20823 631 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TGFBR2P37173 567 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ZNF131P52739 623 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 GALCP54803 685 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 PTP4A2Q12974 167 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 GAGE2BQ13066 116 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 BAMBIQ13145 260 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 UBE2V1Q13404 147 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 MVPQ14764 893 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SLC35G1Q2M3R5 365 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 GAGE2EQ4V326 116 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ZNF805Q5CZA5 627 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ZNF789Q5FWF6 425 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 C6orf136Q5SQH8 315 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 GCNT6Q5T4J0 391 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 REP15Q6BDI9 236 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 GAGE2AQ6NT46 116 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SPNS3Q6ZMD2 512 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 MCM10Q7L590 875 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SYT13Q7L8C5 426 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TRIML1Q8N9V2 468 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 C11orf65Q8NCR3 313 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 NPEPL1Q8NDH3 523 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 OR10G2Q8NGC3 310 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 OR6X1Q8NH79 312 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 UBALD1Q8TB05 177 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ZNF566Q969W8 418 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 MARC2Q969Z3 335 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 DDOQ99489 341 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TBC1D17Q9HA65 648 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SLC28A3Q9HAS3 691 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 DEPPQ9NTK1 212 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 WDR35Q9P2L0 1181 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 GAGE2DQ9UEU5 116 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 MTUS1Q9ULD2 1270 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 CCPG1Q9ULG6 757 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 LRRK1Q38SD2 2015 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ADGRL1O94910 1474 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 FRAS1Q86XX4 4008 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 PARD3Q8TEW0 1356 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 FSD2A1L4K1 749 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 A6NDX4 124 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 C2orf81A6NN90 581 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ENO4A6NNW6 628 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1241P-201ENST00000384536 RNF103O00237 685 aa-1.06□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms