RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 CPNE5Q9HCH3 593 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 STARD5Q9NSY2 213 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 OPTCQ9UBM4 332 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 DCDC2Q9UHG0 476 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 SH2B3Q9UQQ2 575 aa14.69□□□□□ -0.06
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PGGT1B-202ENST00000379615 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa14.69□□□□□ -0.06
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR1F1O43749 312 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 CTSBP07858 339 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 GSTA1P08263 222 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC35G6P0C7Q6 338 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 MTHFD2P13995 350 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PTPN4P29074 926 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 AHRP35869 848 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 SLCO1A2P46721 670 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 GCGRP47871 477 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PIK3CGP48736 1102 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 SETDB1Q15047 1291 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PFKFB4Q16877 469 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 C1orf189Q5VU69 101 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.68□□□□□ -0.06
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PGGT1B-202ENST00000379615 TRPV3Q8NET8 790 aa14.68□□□□□ -0.06
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 STARD8Q92502 1023 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PRORYQ9H606 182 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 IL17BQ9UHF5 180 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 BAHCC1Q9P281 2608 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 TLDC2A0PJX2 215 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 FEZF1A0PJY2 475 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 SMIM23A6NLE4 172 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 TERTO14746 1132 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 KLK8O60259 260 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 ERLIN1O75477 346 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 ONECUT2O95948 504 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PYGBP11216 843 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 EPB42P16452 691 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 TAC1P20366 129 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 GSTM2P28161 218 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 BCL6P41182 706 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 REEP5Q00765 189 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 IRF8Q02556 426 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 LAPTM5Q13571 262 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PWP1Q13610 501 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM53BQ14153 422 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 NCF4Q15080 339 aa14.67□□□□□ -0.06
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PGGT1B-202ENST00000379615 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 MLIPQ5VWP3 458 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 ATG9BQ674R7 924 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 SYVN1Q86TM6 617 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 ESAMQ96AP7 390 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 CATSPER2Q96P56 530 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF358Q9NW07 568 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 XPR1Q9UBH6 696 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
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PGGT1B-202ENST00000379615 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 STX16O14662 325 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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PGGT1B-202ENST00000379615 SCTRP47872 440 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 AVPR1BP47901 424 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 CCT5P48643 541 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 SKP1P63208 163 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 RGS1Q08116 209 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 TBCCQ15814 346 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 HKDC1Q2TB90 917 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXO48Q5FWF7 155 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 XKR6Q5GH73 641 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 VN1R4Q7Z5H5 301 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 TEX9Q8N6V9 391 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 UBE2E3Q969T4 207 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 COL26A1Q96A83 441 aa14.66□□□□□ -0.06
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