RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 C1QCP02747 245 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SRCP12931 536 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 LHCGRP22888 699 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PTPN6P29350 595 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 KIR3DL1P43629 444 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 MASP1P48740 699 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PTPN5P54829 565 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CDK5R2Q13319 367 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CARD16Q5EG05 197 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CDKL4Q5MAI5 379 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 NOXRED1Q6NXP6 359 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 GATAD2AQ86YP4 633 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SYT12Q8IV01 421 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PEX5LQ8IYB4 626 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ASB11Q8WXH4 323 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PROX1Q92786 737 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 NELL1Q92832 810 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 TESCQ96BS2 214 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 P2RY13Q9BPV8 354 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 BBS2Q9BXC9 721 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ADPRHL2Q9NX46 363 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF221Q9UK13 617 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ABCG2Q9UNQ0 655 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa12.76□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 hCG_2039718K7EN88 272 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CLIC1O00299 241 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CCRL2O00421 344 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SLC16A6O15403 523 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ANGPTL1O95841 491 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 FADS2O95864 444 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PTTG1O95997 202 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 AMD1P17707 334 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CHRNEQ04844 493 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CHIT1Q13231 466 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 RAB33AQ14088 237 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CLCA4Q14CN2 919 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 FRG2Q64ET8 278 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CPZQ66K79 652 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SIGIRRQ6IA17 410 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PRSS48Q7RTY5 328 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CMTM8Q8IZV2 173 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PSD4Q8NDX1 1056 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 FIBINQ8TAL6 211 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 LGALS12Q96DT0 336 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 FRG2BQ96QU4 278 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 IL21Q9HBE4 155 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 DNAJC11Q9NVH1 559 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ALX3O95076 343 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 FKBP9O95302 570 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PARNO95453 639 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 URODP06132 367 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ENGP17813 658 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 IL1RNP18510 177 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CYP2A7P20853 494 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 RYKP34925 604 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 HNMTP50135 292 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 GGTA1PQ4G0N0 100 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SNAP47Q5SQN1 464 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 OR2T5Q6IEZ7 315 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CEP68Q76N32 757 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CYP4Z1Q86W10 505 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SYTL1Q8IYJ3 562 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 METTL4Q8N3J2 472 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 L3MBTL4Q8NA19 623 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 OR6F1Q8NGZ6 308 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 OR2T29Q8NH02 315 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 LYSMD1Q96S90 227 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 KLHL42Q9P2K6 505 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa12.75□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 AGAP5A6NIR3 686 aa12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 A8MV72 311 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PRAMEF4O60810 478 aa12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 COX7A2P14406 83 aa12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 GJA1P17302 382 aa12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 IL18R1Q13478 541 aa12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 NPTX1Q15818 432 aa12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 DUOXA1Q1HG43 343 aa12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 AGAP6Q5VW22 663 aa12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 LAIR1Q6GTX8 287 aa12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 GDPD3Q7L5L3 318 aa12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms