RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHPT1Q8WUD6 406 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHURC1Q8WUH1 139 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEPT1Q8WYJ6 367 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 EXT2Q93063 718 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PYCR2Q96C36 320 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RMDN1Q96DB5 314 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PGM2Q96G03 612 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RMDN2Q96LZ7 410 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPATA33Q96N06 139 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TXLNGYQ9BZA5 131 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 FZD8Q9H461 694 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RABEP2Q9H5N1 569 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 EGLN3Q9H6Z9 239 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF121Q9H920 327 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBC1D13Q9NVG8 400 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 HACD3Q9P035 362 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP2.54□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PPR1 153 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTMR11A4FU01 709 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACOD1A6NK06 481 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 A8MXK9 166 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYTIPO60759 359 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 STAG3L1P0CL83 205 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPORP19235 508 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTGER3P43115 390 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTCP1P56278 107 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 MZT1Q08AG7 82 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 COG2Q14746 738 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBBP7Q16576 425 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCP11X2Q5H9J9 407 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 C16orf54Q6UWD8 224 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 AMIGO1Q86WK6 493 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM131BQ86XD5 332 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 POM121L12Q8N7R1 296 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC63Q8NA47 563 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 C17orf47Q8NEP4 570 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPRL2Q8WTW4 380 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PI4K2AQ9BTU6 479 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CENPOQ9BU64 300 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC25A23Q9BV35 468 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PARLQ9H300 379 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 FN3KQ9H479 309 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PKD2L2Q9NZM6 624 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 POLLQ9UGP5 575 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL36AQ9UHA7 158 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF510Q9Y2H8 683 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL16Q14005 1332 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 A8MXE2 369 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPIPB9F8W1W9 429 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 G3V2L1 256 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 POP4O95707 220 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNTTP04053 509 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 F3P13726 295 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 HOXC13P31276 330 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT20P35900 424 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR1D5P58170 312 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAMK2DQ13557 499 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 MS4A18Q3C1V0 323 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALDH1L2Q3SY69 923 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTC27Q6P3X3 843 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHST3Q7LGC8 479 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR10G7Q8NGN6 311 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 VPS33AQ96AX1 596 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDNQ99608 321 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAI2Q9GZS0 605 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD2Q9GZV1 360 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNX25Q9H3E2 840 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 NLGN3Q9NZ94 848 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 C5AR2Q9P296 337 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTSZQ9UBR2 303 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 PILRBQ9UKJ0 227 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTLL3Q9Y4R7 772 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPHP3Q7Z494 1330 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A087WZ39 114 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 F8VVB4 439 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 F8VWA3 439 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAP30O75446 220 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 NXPH4O95158 308 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 YES1P07947 543 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC175P0C221 793 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYOGP15173 224 aa2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms