RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338045.7

LIMS1-202, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-202ENST00000338045 SLC15A3Q8IY34 581 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 OR2L3Q8NG85 312 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 JADE3Q92613 823 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 EBPLQ9BY08 206 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 IL1RL2Q9HB29 575 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 CD320Q9NPF0 282 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 POT1Q9NUX5 634 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 A0A0G2JNG1 304 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 KIR2DS3K7RE56 304 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 ACOT8O14734 319 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 MAP3K7O43318 606 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 CCNDBP1O95273 360 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 HOXA6P31267 233 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 ZXDAP98168 799 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 CCNIQ14094 377 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 KIR2DS5Q14953 304 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 SPATS1Q496A3 300 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 SYT12Q8IV01 421 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 METTL4Q8N3J2 472 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 RNF148Q8N7C7 305 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 OR4E2Q8NGC2 313 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 GTF2H4Q92759 462 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 HSPA12BQ96MM6 686 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 SARGQ9BW04 601 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 OR51B5Q9H339 312 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 SLC6A20Q9NP91 592 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 TMEM184CQ9NVA4 438 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 SLAMF8Q9P0V8 285 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-202ENST00000338045 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 TRBC2A0A5B9 178 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 ANKDD1BA6NHY2 528 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 TLR4O00206 839 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 NME4O00746 187 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 MAP3K13O43283 966 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 SEMA3DO95025 777 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 PSMG1O95456 288 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 CSF2P04141 144 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 CTSEP14091 401 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 JUNDP17535 347 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 BCKDHBP21953 392 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 HRH2P25021 359 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 MAOBP27338 520 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 ASMTP46597 345 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 PHC1P78364 1004 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 MS4A2Q01362 244 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 DPY19L1Q2PZI1 675 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 COMMD6Q7Z4G1 85 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 DHDDSQ86SQ9 333 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 FBXL6Q8N531 539 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 DNASE2BQ8WZ79 361 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 STMN2Q93045 179 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 TMEM125Q96AQ2 219 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 ASB9Q96DX5 294 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 LRRC61Q9BV99 259 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 MS4A8Q9BY19 250 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 TM9SF3Q9HD45 589 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 CMTM6Q9NX76 183 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 CPNE7Q9UBL6 633 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa14.82□□□□□ -0.04
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LIMS1-202ENST00000338045 BTN3A3O00478 584 aa14.82□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 PCDH7O60245 1069 aa14.82□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 SH3BGRLO75368 114 aa14.82□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 KRT36O76013 467 aa14.82□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 PWP1Q13610 501 aa14.82□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 GPR18Q14330 331 aa14.82□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.82□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 PRRT3Q5FWE3 981 aa14.82□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 DEPDC1Q5TB30 811 aa14.82□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF425Q6IV72 752 aa14.82□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 AAGABQ6PD74 315 aa14.82□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa14.82□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 ARPINQ7Z6K5 226 aa14.82□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 NAGSQ8N159 534 aa14.82□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 GPR156Q8NFN8 814 aa14.82□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 TTLQ8NG68 377 aa14.82□□□□□ -0.04
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