RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 PELI2Q9HAT8 420 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 GABRR3A8MPY1 467 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 RFXANKO14593 260 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 C1QCP02747 245 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 GGT1P19440 569 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 IL10P22301 178 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 PIK3CBP42338 1070 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 C21orf58P58505 322 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 KRT33BQ14525 404 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 DUOXA1Q1HG43 343 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 DPY19L1Q2PZI1 675 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 UAP1L1Q3KQV9 507 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 LRIT3Q3SXY7 679 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 MTX3Q5HYI7 312 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 GCNT7Q6ZNI0 430 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZS52 159 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 ERMP1Q7Z2K6 904 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 RD3Q7Z3Z2 195 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 C10orf111Q8N326 155 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 GALNT4Q8N4A0 578 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 OR2T12Q8NG77 320 aa17.19■□□□□ 0.34
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ACTB-201ENST00000331789 GBP5Q96PP8 586 aa17.19■□□□□ 0.34
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ACTB-201ENST00000331789 V9GYQ6 96 aa17.19■□□□□ 0.34
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ACTB-201ENST00000331789 H7BY64 318 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 KLHL18O94889 574 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 UQCRBP14927 111 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 ASMTP46597 345 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 NFATC4Q14934 902 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 RPE65Q16518 533 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 GALNT18Q6P9A2 607 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 CLECL1Q8IZS7 167 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 PGBD3Q8N328 593 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 CATSPER1Q8NEC5 780 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 NSMCE2Q96MF7 247 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 PRAP1Q96NZ9 151 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 WASH6PQ9NQA3 447 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 SIRT5Q9NXA8 310 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 ERVK-11Q9UQG0 969 aa17.18■□□□□ 0.34
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ACTB-201ENST00000331789 LRRC72A6NJI9 287 aa17.17■□□□□ 0.34
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ACTB-201ENST00000331789 TPST1O60507 370 aa17.17■□□□□ 0.34
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ACTB-201ENST00000331789 GPIP06744 558 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 GZMMP51124 257 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 PHEXP78562 749 aa17.17■□□□□ 0.34
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ACTB-201ENST00000331789 CPTPQ5TA50 214 aa17.17■□□□□ 0.34
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ACTB-201ENST00000331789 DENND6BQ8NEG7 585 aa17.17■□□□□ 0.34
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ACTB-201ENST00000331789 OR8J2Q8NGG1 315 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 EME1Q96AY2 570 aa17.17■□□□□ 0.34
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ACTB-201ENST00000331789 COQ10BQ9H8M1 238 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 ANAPC2Q9UJX6 822 aa17.17■□□□□ 0.34
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ACTB-201ENST00000331789 ANXA6P08133 673 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 AK4P27144 223 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 PKLRP30613 574 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 TRPC1P48995 793 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 RAB28P51157 221 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 CCR8P51685 355 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 CYP4F2P78329 520 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 CALHM3Q86XJ0 350 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 RAB42Q8N4Z0 105 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD53Q8N9V6 530 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 ABHD11Q8NFV4 315 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 OR52E1Q8NGJ3 308 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 FIG4Q92562 907 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 WDR92Q96MX6 357 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-201ENST00000331789 PANX1Q96RD7 426 aa17.17■□□□□ 0.34
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