RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308521.9

APOBEC3F-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3F, Length 2,694 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3F-201ENST00000308521 TPRKBQ9Y3C4 175 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 MAU2Q9Y6X3 613 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 ELOVL7A1L3X0 281 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 PTGES3LE9PB15 166 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 CXCR6O00574 342 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 BCKDKO14874 412 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 HS6ST1O60243 411 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 TRBC1P01850 177 aa10□□□□□ -0.81
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APOBEC3F-201ENST00000308521 PPP5CP53041 499 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 ERVPABLB-1P60509 514 aa10□□□□□ -0.81
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APOBEC3F-201ENST00000308521 ZNF181Q2M3W8 571 aa10□□□□□ -0.81
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APOBEC3F-201ENST00000308521 GPR149Q86SP6 731 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 P2RY8Q86VZ1 359 aa10□□□□□ -0.81
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APOBEC3F-201ENST00000308521 CCDC90BQ9GZT6 254 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 SUV39H2Q9H5I1 410 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 VAPAQ9P0L0 249 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 ZNF221Q9UK13 617 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa10□□□□□ -0.81
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APOBEC3F-201ENST00000308521 SERPINA4P29622 427 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 CD6P30203 668 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 NR4A2P43354 598 aa9.99□□□□□ -0.81
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APOBEC3F-201ENST00000308521 FADDQ13158 208 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 COL19A1Q14993 1142 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 PTPRNQ16849 979 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 CARD16Q5EG05 197 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 SYCE2Q6PIF2 218 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 HS3ST5Q8IZT8 346 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 CLIP4Q8N3C7 705 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 OR2A12Q8NGT7 310 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 RHOXF1Q8NHV9 184 aa9.99□□□□□ -0.81
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APOBEC3F-201ENST00000308521 GTF2H4Q92759 462 aa9.99□□□□□ -0.81
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APOBEC3F-201ENST00000308521 SFXN1Q9H9B4 322 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 NUDT4Q9NZJ9 180 aa9.99□□□□□ -0.81
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APOBEC3F-201ENST00000308521 ZNF229Q9UJW7 825 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 PRRT4C9JH25 899 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 VPS26AO75436 327 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 ITGB6P18564 788 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 HMGCLP35914 325 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 SLC35A2P78381 396 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 VAC14Q08AM6 782 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 KEAP1Q14145 624 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 RUNDC3AQ59EK9 446 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 ARSIQ5FYB1 569 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 LETMD1Q6P1Q0 360 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 RNF165Q6ZSG1 346 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 SLC22A16Q86VW1 577 aa9.99□□□□□ -0.81
APOBEC3F-201ENST00000308521 MICU2Q8IYU8 434 aa9.99□□□□□ -0.81
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