RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306149.11

CSDC2-201, Transcript of cold shock domain containing C2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDC2, Length 2,777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDC2-201ENST00000306149 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 FZD4Q9ULV1 537 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 ZNF232Q9UNY5 417 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 OBSL1O75147 1896 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 POP4O95707 220 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 OPN1SWP03999 348 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 SEMG1P04279 462 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 PCSK2P16519 638 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 FPR1P21462 350 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 BDKRB1P46663 353 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 PTPN5P54829 565 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 CREMQ03060 361 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 MVKQ03426 396 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 TTC23LQ6PF05 361 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 PGBD3Q8N328 593 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 SAMD11Q96NU1 681 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 OR4K3Q96R72 315 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 APOL4Q9BPW4 351 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 CORO1BQ9BR76 489 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 FAM83DQ9H4H8 585 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 CREBZFQ9NS37 354 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 TMEM184CQ9NVA4 438 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 SCN3BQ9NY72 215 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 HS3ST2Q9Y278 367 aa14.61□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 TGM5O43548 720 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 NADKO95544 446 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 VIPP01282 170 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 ACPPP15309 386 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 CTSCP53634 463 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 CLCA4Q14CN2 919 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 CYP27C1Q4G0S4 372 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 GPR153Q6NV75 609 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 AHSA2Q719I0 299 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 CPXM2Q8N436 756 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 SVOPQ8N4V2 548 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 WDR20Q8TBZ3 569 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 LMLNQ96KR4 655 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 DUSP26Q9BV47 211 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 REEP1Q9H902 201 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 SGK2Q9HBY8 427 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 PPIL1Q9Y3C6 166 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 TMEM247A6NEH6 219 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 TSPAN6O43657 245 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 CXCL10P02778 98 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 LCKP06239 509 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 MPC1LP0DKB6 136 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 KRT20P35900 424 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 DEFB103AP81534 67 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 GAB1Q13480 694 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 MPP7Q5T2T1 576 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 CBLL1Q75N03 491 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 BTBD2Q9BX70 525 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 RUBCNLQ9H714 662 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 RPS6KA6Q9UK32 745 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 KIAA1671Q9BY89 1806 aa14.6□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 PCDHGA12O60330 932 aa14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 BMP4P12644 408 aa14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 WEE1P30291 646 aa14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 RAE1P78406 368 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 CD300CQ08708 224 aa14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 AGTRAPQ6RW13 159 aa14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 GDPD4Q6W3E5 623 aa14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 NAGSQ8N159 534 aa14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 ZNF366Q8N895 744 aa14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 OR2A12Q8NGT7 310 aa14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 KCNC2Q96PR1 638 aa14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 NPIPB8E9PQR5 432 aa14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 PCDH7O60245 1069 aa14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 SLC16A8O95907 504 aa14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 TGM1P22735 817 aa14.59□□□□□ -0.07
CSDC2-201ENST00000306149 PDHA2P29803 388 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms