RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299578.9

C16orf46-201, Transcript of chromosome 16 open reading frame 46, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene C16orf46, Length 1,605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf46-201ENST00000299578 EFCAB1Q9HAE3 211 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 PFDN4Q9NQP4 134 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 PDP2Q9P2J9 529 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 A8MU76 341 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ISM1B1AKI9 464 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 AZIN1O14977 448 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 UBDO15205 165 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ADRB1P08588 477 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ANKRD34CP0C6C1 535 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 IMPA1P29218 277 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 CLCQ05315 142 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 SLC34A1Q06495 639 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 LCP2Q13094 533 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 UGT3A2Q3SY77 523 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 CACHD1Q5VU97 1274 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 SPESP1Q6UW49 350 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 PRSS42Q7Z5A4 293 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 SNX32Q86XE0 403 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 GPSM1Q86YR5 675 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 DEFB107AQ8IZN7 70 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 FBXW8Q8N3Y1 598 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 SMPDL3AQ92484 453 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 JADE3Q92613 823 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 MAP3K3Q99759 626 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 EGFL8Q99944 293 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 TWSG1Q9GZX9 223 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 MID1IP1Q9NPA3 183 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 KLK13Q9UKR3 277 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 FIS1Q9Y3D6 152 aa11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 H0Y3Z8 333 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 AGRPO00253 132 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 VPS4BO75351 444 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 MLYCDO95822 493 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 RPS17P08708 135 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 CDH3P22223 829 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 AP2B1P63010 937 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 SH3BP2P78314 561 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 CDKL1Q00532 357 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 STX5Q13190 355 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 RCN1Q15293 331 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 TGFBIQ15582 683 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 KANK2Q63ZY3 851 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 TMEM198Q66K66 360 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 AGTRAPQ6RW13 159 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 SUSD1Q6UWL2 747 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ERMP1Q7Z2K6 904 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 TRIM73Q86UV7 250 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 HOMEZQ8IX15 550 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 PPFIBP2Q8ND30 876 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ATL1Q8WXF7 558 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 FBXL8Q96CD0 374 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 C19orf60Q96EN9 201 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 CLPTM1LQ96KA5 538 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 PPM1MQ96MI6 270 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 OR2A14Q96R47 310 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 SCNM1Q9BWG6 230 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 NUDT4Q9NZJ9 180 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 WASF3Q9UPY6 502 aa11.46□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 CCDC187A0A096LP49 1063 aa11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 A0A0J9YY10 115 aa11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 A0A1W2PPV9 198 aa11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 E7ENX8 843 aa11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 AIM2O14862 343 aa11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 KRT36O76013 467 aa11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 ANXA5P08758 320 aa11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 SPINK2P20155 84 aa11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 PSMB5P28074 263 aa11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 SEPHS1P49903 392 aa11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 NUDT2P50583 147 aa11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 MTTPP55157 894 aa11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 CDH13P55290 713 aa11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 TBPL1P62380 186 aa11.46□□□□□ -0.58
C16orf46-201ENST00000299578 TAP2Q03519 686 aa11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms