RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 KRT33BQ14525 404 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 NFATC4Q14934 902 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 DPY19L1Q2PZI1 675 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 UAP1L1Q3KQV9 507 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 ANO7Q6IWH7 933 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 GALNT18Q6P9A2 607 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 RD3Q7Z3Z2 195 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 KRT78Q8N1N4 520 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 C10orf111Q8N326 155 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 OR2T12Q8NG77 320 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 WDR48Q8TAF3 677 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 INVSQ9Y283 1065 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC72A6NJI9 287 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 H7BY64 318 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 PIK3CBP42338 1070 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 C21orf58P58505 322 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 MTX3Q5HYI7 312 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 PGBD3Q8N328 593 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 GOLM1Q8NBJ4 401 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 ICA1LQ8NDH6 482 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 OR8J2Q8NGG1 315 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 PRAP1Q96NZ9 151 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 GBP5Q96PP8 586 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 SH3GL1Q99961 368 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 TBCDQ9BTW9 1192 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 WASH6PQ9NQA3 447 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 AK5Q9Y6K8 562 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 GABRR3A8MPY1 467 aa21.86■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 TPST1O60507 370 aa21.86■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 C1QCP02747 245 aa21.86■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 ASMTP46597 345 aa21.86■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 RAB28P51157 221 aa21.86■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 RPE65Q16518 533 aa21.86■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 GCNT7Q6ZNI0 430 aa21.86■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa21.86■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 RAB42Q8N4Z0 105 aa21.86■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD53Q8N9V6 530 aa21.86■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 NELL1Q92832 810 aa21.86■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 BIRC7Q96CA5 298 aa21.86■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 PCBD2Q9H0N5 130 aa21.86■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 PELI2Q9HAT8 420 aa21.86■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 ERVK-11Q9UQG0 969 aa21.86■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 V9GYQ6 96 aa21.86■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 FEZF1A0PJY2 475 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 GGT1P19440 569 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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VSTM4-201ENST00000298454 AK4P27144 223 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 ERMP1Q7Z2K6 904 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 CLECL1Q8IZS7 167 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 ABHD11Q8NFV4 315 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 OR52E1Q8NGJ3 308 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 NSMCE2Q96MF7 247 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 PANX1Q96RD7 426 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 SIRT5Q9NXA8 310 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D29Q9UFV1 150 aa21.85■■□□□ 1.09
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VSTM4-201ENST00000298454 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 CROCCQ5TZA2 2017 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL18O94889 574 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 EML2O95834 649 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 GPIP06744 558 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 SRFP11831 508 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 CCR8P51685 355 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 CYP4F2P78329 520 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 PHEXP78562 749 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 DUOXA1Q1HG43 343 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 CCL4L1Q8NHW4 92 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 EME1Q96AY2 570 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 MSANTD3Q96H12 275 aa21.85■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 WDR92Q96MX6 357 aa21.85■■□□□ 1.09
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VSTM4-201ENST00000298454 PKLRP30613 574 aa21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 METTL4Q8N3J2 472 aa21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 GALNT4Q8N4A0 578 aa21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 CATSPER1Q8NEC5 780 aa21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 DUSP26Q9BV47 211 aa21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 ICKQ9UPZ9 632 aa21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 TRIOO75962 3097 aa21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 CTBSQ01459 385 aa21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF763Q0D2J5 394 aa21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 SLC14A1Q13336 389 aa21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 TDGQ13569 410 aa21.84■■□□□ 1.09
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