RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 FLYWCH1Q4VC44 716 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 KCTD11Q693B1 232 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 AFTPHQ6ULP2 937 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 MFSD7Q6UXD7 560 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 OTOAQ7RTW8 1153 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD37Q7Z713 158 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 PCGF5Q86SE9 256 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00523Q86TU6 105 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC22A16Q86VW1 577 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF18BQ86Y91 864 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 RCOR2Q8IZ40 523 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM156Q8N614 296 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2A1Q8NGT9 310 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 OR51Q1Q8NH59 317 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 ARSGQ96EG1 525 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA13Q96N96 652 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 MDFIQ99750 246 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC40Q9H9A6 602 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKHQ9HCJ1 492 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM114A2Q9NRY5 505 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.4□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.4□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 MACROD2A1Z1Q3 448 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPB2A8KAH6 182 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 NPIPA2E9PIF3 369 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 NPIPA3F8WFD2 350 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL22O00626 93 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 DVL2O14641 736 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 FFAR3O14843 346 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR42O15529 346 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PEX1O43933 1283 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF5CO60282 957 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 GPC4O75487 556 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 WISP2O76076 250 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 APOC2P02655 101 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TUBB4AP04350 444 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 GABRA1P14867 456 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 BMP7P18075 431 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 HRH2P25021 359 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMB4P28070 264 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 RBL1P28749 1068 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PCSK6P29122 969 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CCR7P32248 378 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CDKN2BP42772 138 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGA8P53708 1063 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAMEP78395 509 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 MPP1Q00013 466 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP19Q14CB8 494 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ABRAXAS2Q15018 415 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPB2Q16082 182 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC18A3Q16572 532 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 HKDC1Q2TB90 917 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 P3H1Q32P28 736 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 GXYLT1Q4G148 440 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SFT2D3Q587I9 215 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM182AQ5T1J6 154 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 WLSQ5T9L3 541 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO42Q6P3S6 717 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF585AQ6P3V2 769 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 LANCL3Q6ZV70 420 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SULF2Q8IWU5 870 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PIANPQ8IYJ0 282 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 MARVELD2Q8N4S9 558 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 DTWD1Q8N5C7 304 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 GPATCH11Q8N954 259 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PLPP5Q8NEB5 264 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ARMC2Q8NEN0 867 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC35G2Q8TBE7 412 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SARAFQ96BY9 339 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PWWP2AQ96N64 755 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 OR1F2PQ96R84 312 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TTYH2Q9BSA4 534 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ACAT2Q9BWD1 397 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB126Q9BYW3 111 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVK-11Q9UQG0 969 aa7.39□□□□□ -1.23
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