RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC6A20Q9NP91 592 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 DYTNA2CJ06 578 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 SAP18O00422 153 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 BTN3A3O00478 584 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 ACOT8O14734 319 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 LRATO95237 230 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 B3GALT4O96024 378 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 PGRP06401 933 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 ACSM2AQ08AH3 577 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 C1orf61Q13536 156 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 NFYCQ13952 458 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 ACSM2BQ68CK6 577 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 AMIGO1Q86WK6 493 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 NAGSQ8N159 534 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 MFSD2AQ8NA29 543 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 SERPINI1Q99574 410 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 CMTM6Q9NX76 183 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 SPEGQ15772 3267 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 DMDP11532 3685 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 H0Y3Z8 333 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 IL6P05231 212 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 ME2P23368 584 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 NDUFS1P28331 727 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 MAPK1P28482 360 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 CD38P28907 300 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 LPCAT2Q7L5N7 544 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 PLD3Q8IV08 490 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 KRT78Q8N1N4 520 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2L3Q8NG85 312 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC13A3Q8WWT9 602 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 LCN9Q8WX39 176 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 GTF2H4Q92759 462 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2E3Q969T4 207 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 CXorf40BQ96DE9 158 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 HSPA12BQ96MM6 686 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 AIF1LQ9BQI0 150 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC61Q9BV99 259 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 SYNPO2LQ9H987 977 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 OR6C2Q9NZP2 312 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 WDFY4Q6ZS81 3184 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 AXIN1O15169 862 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMG1O95456 288 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 SHMT2P34897 504 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR18Q14330 331 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 SPIN4Q56A73 249 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 RABL3Q5HYI8 236 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 COMMD6Q7Z4G1 85 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.978e-7■■■■■ 41.5
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAJB14Q8TBM8 379 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM125Q96AQ2 219 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 TESCQ96BS2 214 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 GSDMCQ9BYG8 508 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHAC1Q9H158 963 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 SERHLQ9NQF3 203 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 GID8Q9NWU2 228 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM38O00635 465 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 GBAP04062 536 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP4F2P78329 520 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 PLIN5Q00G26 463 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXM1Q08050 763 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 UGT8Q16880 541 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 NANOGP8Q6NSW7 305 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 TSSK4Q6SA08 328 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR48Q8TAF3 677 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB18Q99592 522 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 DCLRE1BQ9H816 532 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 NANOGQ9H9S0 305 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 TM9SF3Q9HD45 589 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC6A13Q9NSD5 602 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 BTBD3Q9Y2F9 522 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 TECTAO75443 2155 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 JUNDP17535 347 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.987e-8■□□□□ 8.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms