RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221265.7

PAF1-201, Transcript of PAF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PAF1, Length 2,066 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1-201ENST00000221265 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 DHRS12A0PJE2 317 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 METTL12A8MUP2 240 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 ARPC2O15144 300 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 AKAP10O43572 662 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 KCNJ13O60928 360 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 OR6B1O95007 311 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 RPN2P04844 631 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 ERGP11308 486 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 JUPP14923 745 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 PSMB5P28074 263 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 RPL5P46777 297 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 GSK3BP49841 420 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 ZXDAP98168 799 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 OSBPL11Q9BXB4 747 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 EPB41L1Q9H4G0 881 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 GPR27Q9NS67 375 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 AURKCQ9UQB9 309 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 SPEGQ15772 3267 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 FAM234BA2RU67 622 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 SOCS2O14508 198 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 CLPTM1O96005 669 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 KRT6AP02538 564 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 KRT6BP04259 564 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 WNT1P04628 370 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 KRT6CP48668 564 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 TBCELQ5QJ74 424 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 FRG2Q64ET8 278 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 SFTPA2Q8IWL1 248 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 ADGRG5Q8IZF4 528 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 ZFAND2BQ8WV99 257 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 FRG2BQ96QU4 278 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.59□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa14.58□□□□□ -0.07
PAF1-201ENST00000221265 A0A1W2PPV9 198 aa14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 AXIN1O15169 862 aa14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 LIPEQ05469 1076 aa14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 APOFQ13790 326 aa14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 CYP2A13Q16696 494 aa14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 LIPJQ5W064 366 aa14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 CARM1Q86X55 608 aa14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 ZFAND4Q86XD8 727 aa14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 METTL25Q8N6Q8 603 aa14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 NUDT8Q8WV74 236 aa14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 HSPA12BQ96MM6 686 aa14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 TMEM74Q96NL1 305 aa14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 ALG2Q9H553 416 aa14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 SNX6Q9UNH7 406 aa14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 CROCCQ5TZA2 2017 aa14.58□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa14.57□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 TCRBV5S2A0A599 114 aa14.57□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 A6NCN8 305 aa14.57□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 CD27P26842 260 aa14.57□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 EMX2Q04743 252 aa14.57□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 KRT33BQ14525 404 aa14.57□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.57□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.57□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 IFNEQ86WN2 208 aa14.57□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 TMEFF1Q8IYR6 380 aa14.57□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa14.57□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 ZNF740Q8NDX6 193 aa14.57□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.57□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 WDR20Q8TBZ3 569 aa14.57□□□□□ -0.08
PAF1-201ENST00000221265 PATE1Q8WXA2 126 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms