RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-205ENST00000641549 COMMD4Q9H0A8 199 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 MS4A12Q9NXJ0 267 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 REM1O75628 298 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF823P16415 610 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ABATP80404 500 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 FRRS1Q6ZNA5 592 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC29A4Q7RTT9 530 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TMEM126BQ8IUX1 230 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 MVB12BQ9H7P6 319 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TMEM138Q9NPI0 162 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TRBC2A0A5B9 178 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 KCNJ13O60928 360 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 DHFRP00374 187 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 GJA5P36382 358 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 DHCR24Q15392 516 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ANKLE1Q8NAG6 615 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 RNF31Q96EP0 1072 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 PYURFQ96I23 114 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ING4Q9UNL4 249 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 MYH11P35749 1972 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 HEPACAM2A8MVW5 462 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 MAN2B1O00754 1011 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TP73O15350 636 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 SERPINA3P01011 423 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 F7P08709 466 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 FPR1P21462 350 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ETV3P41162 512 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 PREPP48147 710 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 WNT7BP56706 349 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 PHTF2Q8N3S3 785 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 WDR92Q96MX6 357 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 EPYCQ99645 322 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TAF4O00268 1085 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 XKP51811 444 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 CLLU1OSQ5K130 101 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 SPANXN4Q5MJ08 99 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 C6orf136Q5SQH8 315 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 GPR153Q6NV75 609 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 PRSS58Q8IYP2 241 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 UFD1Q92890 307 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ACTL8Q9H568 366 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TAS2R7Q9NYW3 318 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 CREG1O75629 220 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 RCBTB2O95199 551 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 C9P02748 559 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 CD2P06729 351 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 GKP32189 559 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 CCT3P49368 545 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 STK19P49842 368 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 BCAP31P51572 246 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 NIPAL4Q0D2K0 466 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ELOCQ15369 112 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 CEACAM20Q6UY09 585 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 KCTD8Q6ZWB6 473 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 NAT14Q8WUY8 206 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 REEP4Q9H6H4 257 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TGM5O43548 720 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 NOBOXO60393 691 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TBX10O75333 385 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 KAT7O95251 611 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 FDXRP22570 491 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 MVKQ03426 396 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ST3GAL3Q11203 375 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TICAM1Q8IUC6 712 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 PARP8Q8N3A8 854 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 GPER1Q99527 375 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 OR51B5Q9H339 312 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 EBF2Q9HAK2 575 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 CHD4Q14839 1912 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC35E2BP0CK96 405 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 DNASE1L1P49184 302 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ENPP2Q13822 863 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 GALNT7Q86SF2 657 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 CRELD1Q96HD1 420 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TPK1Q9H3S4 243 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TNFRSF21O75509 655 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms