RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 DHRS7Q9Y394 339 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2AG2A6NM03 316 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 MEN1O00255 615 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 OR1I1O60431 355 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM13O60858 407 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN1O95832 211 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB40ALP0C0E4 278 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 SBK3P0C264 359 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 MYL2P10916 166 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 COL8A1P27658 744 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 STX3Q13277 289 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 PLCL1Q15111 1095 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF787Q6DD87 383 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB2Q8N680 514 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKS4BQ8N8V4 417 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 NAT14Q8WUY8 206 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD49Q8WVL7 239 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 SEC16BQ96JE7 1060 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 MFRPQ9BY79 579 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 TCFL5Q9UL49 500 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCA12Q86UK0 2595 aa23.2■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 F8W8V4 182 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SGTAO43765 313 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 RALBP11234 206 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJB13P59910 316 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 OCRLQ01968 901 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 CSHL1Q14406 222 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF460Q14592 562 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 CHI3L2Q15782 390 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 TECRLQ5HYJ1 363 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 LDLRAP1Q5SW96 308 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 ISCA2Q86U28 154 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 C10orf107Q8IVU9 208 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 OR8K5Q8NH50 307 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 TSSK1BQ9BXA7 367 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 NLNQ9BYT8 704 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM107BQ9H098 131 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 WWP1Q9H0M0 922 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6C74A6NCV1 312 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 AP2A2O94973 939 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 DDAH2O95865 285 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 CD1DP15813 335 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINB5P36952 375 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 CLCN7P51798 805 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 BST1Q10588 318 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSCAN26Q16670 478 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 OTOAQ7RTW8 1153 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA21Q7Z572 469 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 CARFQ8N187 725 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 INPP5DQ92835 1189 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 C19orf60Q96EN9 201 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SCYL1Q96KG9 808 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 MECRQ9BV79 373 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 FER1L5A0AVI2 2057 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM114B3SHH9 223 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 QSOX1O00391 747 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 DPM1O60762 260 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 LDLRP01130 860 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 CHRM3P20309 590 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 ARL4DP49703 201 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 LIPMQ5VYY2 423 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 PAQR3Q6TCH7 311 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 OOSP2Q86WS3 158 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC197Q8NCU1 140 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFPM2Q8WW38 1151 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1191Q96A73 305 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 PNPLA2Q96AD5 504 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 RMDN2Q96LZ7 410 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR21Q99679 349 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 NRTNQ99748 197 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL14Q9P2G3 628 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 XPR1Q9UBH6 696 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 POMT2Q9UKY4 750 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 MGAT4DA6NG13 374 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP99D6REC4 459 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 EBAG9O00559 213 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 GMPRP36959 345 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 DCTP40126 519 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 IL2P60568 153 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC22A9Q8IVM8 553 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 OR1L3Q8NH93 324 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-216ENST00000628306 STAG3L4Q8TBR4 150 aa23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms