RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL42Q9P2K6 505 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 FBN2P35556 2912 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 SMAPO00193 183 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 HAT1O14929 419 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 FGGP02679 453 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 PAMP19021 973 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 ART3Q13508 389 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 TTLL9Q3SXZ7 439 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 ABHD17BQ5VST6 288 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 ADCK2Q7Z695 626 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 PLD3Q8IV08 490 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJB8Q8NHS0 232 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 GIMAP7Q8NHV1 300 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 MAIP1Q8WWC4 291 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 TUBB6Q9BUF5 446 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 OR5H15A6NDH6 313 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 GFYI3L273 518 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 UNC5CO95185 931 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 RASAL1O95294 804 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 CRYABP02511 175 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 C8orf89P0DMQ9 161 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 MST1P26927 711 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 CDC25BP30305 580 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 NDUFA9Q16795 377 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM207Q6UWW9 146 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 ABCF3Q9NUQ8 709 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 STMN3Q9NZ72 180 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 MED16Q9Y2X0 877 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 H7BY64 318 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 PRAMEF2O60811 474 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 MYBL2P10244 700 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEA6P43360 314 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 AVPR1BP47901 424 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 SARNPP82979 210 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF470Q6ECI4 717 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 CASC4Q6P4E1 433 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 SPNS2Q8IVW8 549 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 PRELID2Q8N945 189 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 OR9A4Q8NGU2 314 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 SUN3Q8TAQ9 357 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 METTL21AQ8WXB1 218 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 PRAP1Q96NZ9 151 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 VN1R1Q9GZP7 353 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 SEC14L3Q9UDX4 400 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 TEKT2Q9UIF3 430 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 CSMD2Q7Z408 3487 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 H0YIG0 161 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 SYF2O95926 243 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 CYC1P08574 325 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 MPC1LP0DKB6 136 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 TERF1P54274 439 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF33BQ06732 778 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 CUL1Q13616 776 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF549Q6P9A3 640 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 CYHR1Q6ZMK1 362 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 MCEMP1Q8IX19 187 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 KCNJ9Q92806 393 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 CYTH2Q99418 400 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 RUBCNLQ9H714 662 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 HOMER3Q9NSC5 361 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 CTAGE9A4FU28 777 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB14O43829 449 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 NSA2O95478 260 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 F7P08709 466 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 GRNP28799 593 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 CA7P43166 264 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.361e-7■□□□□ 10.8
PTPRF-216ENST00000617451 VN1R4Q7Z5H5 301 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 DENND6AQ8IWF6 608 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC120Q96HB5 630 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM184CQ9NVA4 438 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 SAMD15Q9P1V8 674 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 DHRS7Q9Y394 339 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 SCN2AQ99250 2005 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 PDZD2O15018 2839 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 DCHS2Q6V1P9 2916 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEB16A2A368 324 aa23.56■■□□□ 1.36
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