RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 TISP43B9A030 160 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PRSS44E7EML9 344 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 INPPL1O15357 1258 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CA12O43570 354 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PIGRP01833 764 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TACR2P21452 398 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 IDSP22304 550 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 AQP1P29972 269 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TNFSF9P41273 254 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 HCAR3P49019 387 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 DNAJB13P59910 316 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FUT2Q10981 343 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 DSC3Q14574 896 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 XKR4Q5GH76 650 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SSX6Q7RTT6 188 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TMIGD2Q96BF3 282 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ARL6Q9H0F7 186 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FN3KQ9H479 309 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 STUB1Q9UNE7 303 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 A0A1B0GVM2 712 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SLC1A7O00341 560 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GABRDO14764 452 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TLL1O43897 1013 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 IL3P08700 152 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 T-ENOLP0DO92 83 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 HK1P19367 917 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CPN2P22792 545 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CERS1P27544 350 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 APLP1P51693 650 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RPS14P62263 151 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GTF2H2Q13888 395 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 NAPRTQ6XQN6 538 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TM9SF2Q99805 663 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 HHATLQ9HCP6 504 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FAM118AQ9NWS6 357 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MIOSQ9NXC5 875 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PROM1O43490 865 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 KIAA0513O60268 411 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MT-ND2P03891 347 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PLA2G16P53816 162 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TXNDC15Q96J42 360 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CAMK1GQ96NX5 476 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 IPPKQ9H8X2 491 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ABCB8Q9NUT2 735 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SOCS2O14508 198 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CLIC3O95833 236 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PROS1P07225 676 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PTPN2P17706 415 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 M6PRP20645 277 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MAP2K4P45985 399 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ALDH3B2P48448 385 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FNTBP49356 437 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GDF10P55107 478 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 NCS1P62166 190 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 HSPA14Q0VDF9 509 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 HSDL2Q6YN16 418 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms