RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601358.5

TIMM50-216, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMM50, Length 1,481 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-216ENST00000601358 CALCOCO2Q13137 446 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 NDUFA9Q16795 377 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 PHKG1Q16816 387 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 VWA2Q5GFL6 755 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 KIRREL2Q6UWL6 708 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 STRA8Q7Z7C7 330 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 C17orf64Q86WR6 236 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 ZBED8Q8IZ13 594 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 DRC3Q9H069 523 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 DPH5Q9H2P9 285 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 C3orf18Q9UK00 162 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 LRRK2Q5S007 2527 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 FFAR3O14843 346 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 GPR42O15529 346 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 ALOX12BO75342 701 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 VPS4BO75351 444 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 URI1O94763 535 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 STATHP02808 62 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 FDXRP22570 491 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 DSG2Q14126 1118 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 TUBB8Q3ZCM7 444 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 CAPN12Q6ZSI9 719 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 KIF18AQ8NI77 898 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 TM9SF4Q92544 642 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 OLFM1Q99784 485 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 VPS4AQ9UN37 437 aa20.11■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 FAM187AA6NFU0 413 aa20.1■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 I3L1I5 382 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 TP73O15350 636 aa20.1■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 TSPAN12O95859 305 aa20.1■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 GRK3P35626 688 aa20.1■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 SOX8P57073 446 aa20.1■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 SLC6A19Q695T7 634 aa20.1■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 PYROXD1Q8WU10 500 aa20.1■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 PNPLA2Q96AD5 504 aa20.1■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 ERP44Q9BS26 406 aa20.1■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 PSAT1Q9Y617 370 aa20.1■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 NUP210LQ5VU65 1888 aa20.1■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa20.09■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 SCN3AQ9NY46 2000 aa20.09■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 P2RX6O15547 441 aa20.09■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 GUCA1CO95843 209 aa20.09■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 AVPR1BP47901 424 aa20.09■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 EMP2P54851 167 aa20.09■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 AP1S2P56377 157 aa20.09■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 LAPTM4BQ86VI4 370 aa20.09■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 ZADH2Q8N4Q0 377 aa20.09■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 OR11G2Q8NGC1 345 aa20.09■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 ATL1Q8WXF7 558 aa20.09■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 HAUS8Q9BT25 410 aa20.09■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 FEZF1A0PJY2 475 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 E7ESA3 106 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 MAP2K7O14733 419 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 HEXBP07686 556 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 CDH1P12830 882 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 ACPPP15309 386 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 CXCR2P25025 360 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 SLC26A3P40879 764 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 CSNK1G2P78368 415 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 C2orf54Q08AI8 447 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 FAM53BQ14153 422 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 DUPD1Q68J44 220 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 LCTLQ6UWM7 567 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 PYCR2Q96C36 320 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 C8orf44Q96CB5 159 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 MACROD1Q9BQ69 325 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 SGPP1Q9BX95 441 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 SAYSD1Q9NPB0 183 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 MOCS1Q9NZB8 636 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 WHRNQ9P202 907 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 SH2B3Q9UQQ2 575 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa20.08■□□□□ 0.81
TIMM50-216ENST00000601358 PTPN13Q12923 2485 aa20.08■□□□□ 0.8
TIMM50-216ENST00000601358 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa20.07■□□□□ 0.8
TIMM50-216ENST00000601358 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa20.07■□□□□ 0.8
TIMM50-216ENST00000601358 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa20.07■□□□□ 0.8
TIMM50-216ENST00000601358 RAD51CO43502 376 aa20.07■□□□□ 0.8
TIMM50-216ENST00000601358 FOXS1O43638 330 aa20.07■□□□□ 0.8
TIMM50-216ENST00000601358 NPPBP16860 134 aa20.07■□□□□ 0.8
TIMM50-216ENST00000601358 CD97P48960 835 aa20.07■□□□□ 0.8
TIMM50-216ENST00000601358 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TIMM50-216ENST00000601358 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa20.07■□□□□ 0.8
TIMM50-216ENST00000601358 FAAH2Q6GMR7 532 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms