RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 TPMTP51580 245 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CDH4P55283 916 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 EPS8Q12929 822 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF234Q14588 700 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CNGA3Q16281 694 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 SMTNL2Q2TAL5 461 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 C5orf22Q49AR2 442 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 SLC30A6Q6NXT4 461 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM81Q6P7N7 255 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 LRRC31Q6UY01 552 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 RAD9BQ6WBX8 426 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 H2AFVQ71UI9 128 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 RRM2BQ7LG56 351 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 SLFN11Q7Z7L1 901 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM200AQ86VY9 491 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CACUL1Q86Y37 369 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 NTAN1Q96AB6 310 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 SIPA1Q96FS4 1042 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 FEM1CQ96JP0 617 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 C1orf74Q96LT6 269 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 PANX2Q96RD6 677 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 PRORYQ9H606 182 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ZWILCHQ9H900 591 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 GRPEL1Q9HAV7 217 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ELOVL2Q9NXB9 296 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 PEMTQ9UBM1 199 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 OR12D3Q9UGF7 316 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 STON1Q9Y6Q2 735 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CHD5Q8TDI0 1954 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 A0A0D9SEW6 157 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 PIPSLA2A3N6 862 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 C16orf96A6NNT2 1141 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 PLK4O00444 970 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 PRPSAP2O60256 369 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CLDN11O75508 207 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 RNF8O76064 485 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 RHOCP08134 193 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 DESP17661 470 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 GARSP41250 739 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 MTA1Q13330 715 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ENPP2Q13822 863 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 E2F5Q15329 346 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 KIF19Q2TAC6 998 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 KCNT1Q5JUK3 1230 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CDC73Q6P1J9 531 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 NCEH1Q6PIU2 408 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CYP20A1Q6UW02 462 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 DHRS13Q6UX07 377 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 NLRP14Q86W24 1093 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM139Q8IV31 216 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF843Q8N446 348 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 EXD3Q8N9H8 876 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 SETD9Q8NE22 299 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 HSPH1Q92598 858 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 TBC1D31Q96DN5 1066 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ADGRE3Q9BY15 652 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ZYG11BQ9C0D3 744 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 RAI2Q9Y5P3 530 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 NUMA1Q14980 2115 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 A0A0U1RQJ8 604 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 RRP8O43159 456 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CEP104O60308 925 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 SNAP91O60641 907 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 MOCS3O95396 460 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 NR2F1P10589 423 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 GOT1P17174 413 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 GSTM2P28161 218 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 OR1E1P30953 314 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CPOXP36551 454 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms