RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 KCNAB1Q14722 419 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 SETDB1Q15047 1291 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 PTCHD3Q3KNS1 767 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 FCRL6Q6DN72 434 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 ZNF425Q6IV72 752 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 FIGLAQ6QHK4 219 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 ZNF605Q86T29 641 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 TRABD2AQ86V40 505 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 TAX1BP1Q86VP1 789 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 DNAJC22Q8N4W6 341 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 GALNT6Q8NCL4 622 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 PPFIBP2Q8ND30 876 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 ABHD11Q8NFV4 315 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 PGM2Q96G03 612 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 PPM1MQ96MI6 270 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 TMEM79Q9BSE2 394 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 SARGQ9BW04 601 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 FANCEQ9HB96 536 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 SOHLH2Q9NX45 425 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 WWOXQ9NZC7 414 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 CD274Q9NZQ7 290 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 XPR1Q9UBH6 696 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 IL17BQ9UHF5 180 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 RARRES3Q9UL19 164 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 GRID1Q9ULK0 1009 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 SNX7Q9UNH6 387 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 ATMQ13315 3056 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 SMIM23A6NLE4 172 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 SUPT3HB4E1H0 165 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 B8ZZF3 427 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 UBXN8O00124 270 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 TAPBPO15533 448 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 SUPT3HO75486 399 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 STK16O75716 305 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 TIAF1O95411 115 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 FAM87AP0C7U9 286 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 CCNYL3P0C7X3 344 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 SFTPCP11686 197 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 NEFHP12036 1026 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 KRT4P19013 534 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 F8A1P23610 371 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 GLRBP48167 497 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 MC1RQ01726 317 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 CDC16Q13042 620 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 E2F2Q14209 437 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.897e-7■■■■■ 29.2
GGA3-209ENST00000580646 ZIC1Q15915 447 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 KRT71Q3SY84 523 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 CCDC153Q494R4 210 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 RNF44Q7L0R7 432 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 TRIM73Q86UV7 250 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 PAQR7Q86WK9 346 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 C17orf64Q86WR6 236 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 OR4K1Q8NGD4 311 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 THAP11Q96EK4 314 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 ZNF285Q96NJ3 590 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 CATSPER2Q96P56 530 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 OR4K3Q96R72 315 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 DPH7Q9BTV6 452 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 CD244Q9BZW8 370 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 EHD1Q9H4M9 534 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 PELI2Q9HAT8 420 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 SLC6A20Q9NP91 592 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 FGF21Q9NSA1 209 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 ZNF358Q9NW07 568 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 PSD3Q9NYI0 1048 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 TMEM216Q9P0N5 145 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 COPG2Q9UBF2 871 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 PADI1Q9ULC6 663 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 PLCL2Q9UPR0 1127 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 ACTL7BQ9Y614 415 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 KCNE2Q9Y6J6 123 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 HECTD1Q9ULT8 2610 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 CFAP46Q8IYW2 2715 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-209ENST00000580646 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
GGA3-209ENST00000580646 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
GGA3-209ENST00000580646 H3BMH7 237 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms