RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565987.5

NUBP2-208, Transcript of nucleotide binding protein 2, human

TSL 5 BASIC

Gene NUBP2, Length 1,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUBP2-208	ENST00000565987	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		15.01	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		15.01	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		15.01	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	MAP10	Q9P2G4	905 aa		15.01	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	PDE10A	Q9Y233	779 aa		15.01	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		15.01	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987		H7BY64	318 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	KLHL41	O60662	606 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	LDLR	P01130	860 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	STATH	P02808	62 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	ELK3	P41970	407 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	RGS4	P49798	205 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	PGGT1B	P53609	377 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	EMP3	P54852	163 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	TBPL1	P62380	186 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	DR1	Q01658	176 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	C8orf44	Q96CB5	159 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	C19orf60	Q96EN9	201 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	CFAP36	Q96G28	342 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	NAT9	Q9BTE0	207 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	C3orf18	Q9UK00	162 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	TACC2	O95359	2948 aa		15	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	FOXS1	O43638	330 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	C8G	P07360	202 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	RELA	Q04206	551 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987		Q0VFX4	171 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	DSG2	Q14126	1118 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	MORF4L2	Q15014	288 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	PDIK1L	Q8N165	341 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	AMER3	Q8N944	861 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	MVB12A	Q96EY5	273 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	LINGO1	Q96FE5	620 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	CCDC138	Q96M89	665 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	PARVB	Q9HBI1	364 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		14.99	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	TTI1	O43156	1089 aa		14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	ACPP	P15309	386 aa		14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	SLC26A3	P40879	764 aa		14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	ITGA8	P53708	1063 aa		14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	HIF1A	Q16665	826 aa		14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	PHKG1	Q16816	387 aa		14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	SYT16	Q17RD7	645 aa		14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	IQCK	Q8N0W5	287 aa		14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	GPATCH11	Q8N954	259 aa		14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	TM9SF4	Q92544	642 aa		14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	C5orf34	Q96MH7	638 aa		14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	LHPP	Q9H008	270 aa		14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	DRC3	Q9H069	523 aa		14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		14.98	□□□□□ -0.01
NUBP2-208	ENST00000565987	IDS	B3KWA1	339 aa		14.97	□□□□□ -0.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms