RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560890.5

APH1B-210, Transcript of aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit, humanhuman

TSL 3

Gene APH1B, Length 758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1B-210ENST00000560890 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa8.46□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 REPS1Q96D71 796 aa8.46□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 MOCOSQ96EN8 888 aa8.46□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 WDR34Q96EX3 536 aa8.46□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa8.46□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 GSTO2Q9H4Y5 243 aa8.46□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 ZBTB26Q9HCK0 441 aa8.46□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 FAM60AQ9NP50 221 aa8.46□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 MID1IP1Q9NPA3 183 aa8.46□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 ACSS2Q9NR19 701 aa8.46□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 ADGRE2Q9UHX3 823 aa8.46□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 BTRCQ9Y297 605 aa8.46□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.46□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 CACNA1EQ15878 2313 aa8.46□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 CCDC187A0A096LP49 1063 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 FEZF1A0PJY2 475 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 ANKDD1BA6NHY2 528 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 EFCAB7A8K855 629 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 AGRPO00253 132 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 PPP6CO00743 305 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 TXNDC9O14530 226 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 OR7A17O14581 309 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 PRAMEF10O60809 474 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 OR4F21O95013 312 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 ESRRBO95718 433 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 HSPA4LO95757 839 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 FGF4P08620 206 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 JMJD7P0C870 316 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 HGFP14210 728 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 FOLR1P15328 257 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 BGNP21810 368 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 GSTM2P28161 218 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 SCTRP47872 440 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 SLC1A6P48664 564 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 ERVPABLB-1P60509 514 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 SH3BP2P78314 561 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 FOXM1Q08050 763 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 RCN2Q14257 317 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 IL11RAQ14626 422 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 C16orf72Q14CZ0 275 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 ZIC1Q15915 447 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 MANEAQ5SRI9 462 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 GRHL2Q6ISB3 625 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 FRMD7Q6ZUT3 714 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 RAB11FIP2Q7L804 512 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 GPR135Q8IZ08 494 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 KIRREL3Q8IZU9 778 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 CLYBLQ8N0X4 340 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 L3MBTL4Q8NA19 623 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 MFSD9Q8NBP5 474 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 CAMKVQ8NCB2 501 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 TRPV3Q8NET8 790 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 OR52B6Q8NGF0 335 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 OR6Y1Q8NGX8 325 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 METTL6Q8TCB7 284 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 LRRC8CQ8TDW0 803 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 SEC16BQ96JE7 1060 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 CDK15Q96Q40 435 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 OR2A5Q96R48 311 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 ZNF382Q96SR6 550 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 SARGQ9BW04 601 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 NLNQ9BYT8 704 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 FANCEQ9HB96 536 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 FBXO8Q9NRD0 319 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 FGF21Q9NSA1 209 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 THAP1Q9NVV9 213 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 IRAK4Q9NWZ3 460 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 PILRAQ9UKJ1 303 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 RARRES3Q9UL19 164 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 SNX6Q9UNH7 406 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 SH2B3Q9UQQ2 575 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.45□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 B4E171 279 aa8.44□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 H0YIV9 168 aa8.44□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 KLF11O14901 512 aa8.44□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 HAT1O14929 419 aa8.44□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 PRAMEF4O60810 478 aa8.44□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 CTSVO60911 334 aa8.44□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 ULK1O75385 1050 aa8.44□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 CHEK2O96017 543 aa8.44□□□□□ -1.06
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