RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557644.5

NEDD1-213, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD1, Length 2,367 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-213ENST00000557644 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 PLD2O14939 933 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 MAP3K7O43318 606 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 HRH2P25021 359 aa14.63□□□□□ -0.07
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NEDD1-213ENST00000557644 PIK3CGP48736 1102 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 CCNG1P51959 295 aa14.63□□□□□ -0.07
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NEDD1-213ENST00000557644 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.63□□□□□ -0.07
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NEDD1-213ENST00000557644 OR4F6Q8NGB9 312 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 OR1L3Q8NH93 324 aa14.62□□□□□ -0.07
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NEDD1-213ENST00000557644 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 MC2RQ01718 297 aa14.62□□□□□ -0.07
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NEDD1-213ENST00000557644 LCP2Q13094 533 aa14.62□□□□□ -0.07
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NEDD1-213ENST00000557644 OR6Y1Q8NGX8 325 aa14.62□□□□□ -0.07
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NEDD1-213ENST00000557644 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
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NEDD1-213ENST00000557644 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa14.62□□□□□ -0.07
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NEDD1-213ENST00000557644 VN1R4Q7Z5H5 301 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 MILR1Q7Z6M3 343 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 TRBC2A0A5B9 178 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 B4E171 279 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 H3BMH7 237 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD1-213ENST00000557644 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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