RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	C2orf54	Q08AI8	447 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ABR	Q12979	859 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	SNX20	Q7Z614	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	GLRX5	Q86SX6	157 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PIM3	Q86V86	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ARL10	Q8N8L6	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	OR4L1	Q8NH43	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ELMO1	Q92556	727 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	NAT6	Q93015	286 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CFAP36	Q96G28	342 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	COPS8	Q99627	209 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	WWP1	Q9H0M0	922 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	DPH5	Q9H2P9	285 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	RDH14	Q9HBH5	336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	VPS18	Q9P253	973 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	SNX24	Q9Y343	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	SDK2	Q58EX2	2172 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	DMD	P11532	3685 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	MAGEB16	A2A368	324 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	OR5K4	A6NMS3	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288		F8W8V4	182 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC188	H7C350	402 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CES2	O00748	559 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PFDN6	O15212	129 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	OR1I1	O60431	355 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM20B	O75063	409 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	BANF1	O75531	89 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	RASSF9	O75901	435 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	SUN1	O94901	812 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	OR56A5	P0C7T3	313 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PF4V1	P10720	104 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	F3	P13726	295 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	TPSB2	P20231	275 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CHRM3	P20309	590 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CTSC	P53634	463 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	XIAP	P98170	497 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CDK16	Q00536	496 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	PRKG2	Q13237	762 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	ILK	Q13418	452 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	FOXE3	Q13461	319 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-238	ENST00000556288	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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