RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551063.5

PRPF40B-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog B, humanhuman

TSL 4

Gene PRPF40B, Length 531 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40B-211ENST00000551063 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PRPF40B-211ENST00000551063 KIAA1191Q96A73 305 aa14.71□□□□□ -0.05
PRPF40B-211ENST00000551063 RHBDF1Q96CC6 855 aa14.71□□□□□ -0.05
PRPF40B-211ENST00000551063 OR4K3Q96R72 315 aa14.71□□□□□ -0.05
PRPF40B-211ENST00000551063 SARGQ9BW04 601 aa14.71□□□□□ -0.05
PRPF40B-211ENST00000551063 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PRPF40B-211ENST00000551063 SLC26A1Q9H2B4 701 aa14.71□□□□□ -0.05
PRPF40B-211ENST00000551063 ADNPQ9H2P0 1102 aa14.71□□□□□ -0.05
PRPF40B-211ENST00000551063 SYNPO2LQ9H987 977 aa14.71□□□□□ -0.05
PRPF40B-211ENST00000551063 SLC22A11Q9NSA0 550 aa14.71□□□□□ -0.05
PRPF40B-211ENST00000551063 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PRPF40B-211ENST00000551063 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PRPF40B-211ENST00000551063 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.71□□□□□ -0.05
PRPF40B-211ENST00000551063 A0A087X1B8 175 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 CCDC189A1A4V9 331 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 HMX2A2RU54 273 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 FURINP09958 794 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 SFTPCP11686 197 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 FOLR3P41439 243 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 SERPINB9P50453 376 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 POLE2P56282 527 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 NFKB2Q00653 900 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 BMPR2Q13873 1038 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 SLC9A5Q14940 896 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 MROH9Q5TGP6 573 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 VN1R4Q7Z5H5 301 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 GPSM1Q86YR5 675 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 RAB43Q86YS6 212 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 PDPRQ8NCN5 879 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 OR2Y1Q8NGV0 311 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 ISL2Q96A47 359 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 PTERQ96BW5 349 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 CABS1Q96KC9 395 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 PAFAH2Q99487 392 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 PELI2Q9HAT8 420 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 NMRAL1Q9HBL8 299 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 SNX15Q9NRS6 342 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 TUBD1Q9UJT1 453 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 ZNF180Q9UJW8 692 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 CDC14AQ9UNH5 594 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 ACOT9Q9Y305 439 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 SPTA1P02549 2419 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 P2RX6O15547 441 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 C2P06681 752 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 GGT5P36269 586 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 PMS2P54278 862 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 FAM53BQ14153 422 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 OR4D1Q15615 310 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 NDUFA9Q16795 377 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 HKDC1Q2TB90 917 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 TEX35Q5T0J7 233 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 SULT1C3Q6IMI6 304 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 COX15Q7KZN9 410 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 OVCH1Q7RTY7 1134 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 TBC1D19Q8N5T2 526 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 CAMKVQ8NCB2 501 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 NEIL2Q969S2 332 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 WDR54Q9H977 334 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 IGSF5Q9NSI5 407 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 WWOXQ9NZC7 414 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 NUDT4Q9NZJ9 180 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 TLK1Q9UKI8 766 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 RNF112Q9ULX5 631 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 SLC22A14Q9Y267 594 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 KCNMB2Q9Y691 235 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 CFAP46Q8IYW2 2715 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 TRBC2A0A5B9 178 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 KERAO60938 352 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 KRT38O76015 456 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 MED26O95402 600 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 S100BP04271 92 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 FAM87AP0C7U9 286 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 TFEBP19484 476 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 CNTFP26441 200 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 TYK2P29597 1187 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 BCL6P41182 706 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 MSH2P43246 934 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 MAGEA12P43365 314 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF40B-211ENST00000551063 REEP5Q00765 189 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms