RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529524.1

PSMA1-208, Transcript of proteasome subunit alpha 1, human

TSL 3

Gene PSMA1, Length 743 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA1-208	ENST00000529524	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	LACC1	Q8IV20	430 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	TMEM139	Q8IV31	216 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	DCLK2	Q8N568	766 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	ATL1	Q8WXF7	558 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	DYRK2	Q92630	601 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	NXNL1	Q96CM4	212 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	SPDL1	Q96EA4	605 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	PRAM1	Q96QH2	718 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	FGF21	Q9NSA1	209 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	THEG	Q9P2T0	379 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	WDR90	Q96KV7	1748 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF195	O14628	629 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	AHCYL1	O43865	530 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	MAGEC1	O60732	1142 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	CDC25C	P30307	473 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	MMP12	P39900	470 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	PGF	P49763	221 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	NUDT13	Q86X67	352 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524		Q8N377	158 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	KRT12	Q99456	494 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	OLFM1	Q99784	485 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	PANK3	Q9H999	370 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	PANK4	Q9NVE7	773 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	GDE1	Q9NZC3	331 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	IL17B	Q9UHF5	180 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	RARRES3	Q9UL19	164 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	USP47	Q96K76	1375 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	USP6	P35125	1406 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	ABCA3	Q99758	1704 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	MSGN1	A6NI15	193 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	EPHB6	O15197	1021 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	WDPCP	O95876	746 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	LINGO3	P0C6S8	592 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	CDH3	P22223	829 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	EID3	Q8N140	333 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	SLCO2A1	Q92959	643 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	CENPT	Q96BT3	561 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	DGAT2	Q96PD7	388 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	ABHD1	Q96SE0	405 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	GPR83	Q9NYM4	423 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PSMA1-208	ENST00000529524	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87

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