RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 TNFP01375 233 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 TK1P04183 234 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 POLBP06746 335 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 KRT7P08729 469 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 LYL1P12980 280 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 UNGP13051 313 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 VCLP18206 1134 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 TNFAIP3P21580 790 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 CNTFP26441 200 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 GSTM5P46439 218 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 COPB1P53618 953 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 BCL2L1Q07817 233 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF235Q14590 738 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 NFATC4Q14934 902 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 PDK2Q15119 407 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 KRT31Q15323 416 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 UGP2Q16851 508 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM52BQ4KMG9 183 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 FSCBQ5H9T9 825 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 KCNT1Q5JUK3 1230 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ERMARDQ5T6L9 678 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 NAA35Q5VZE5 725 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ACAD10Q6JQN1 1059 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 Q6ZSR6 202 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 RAB11FIP2Q7L804 512 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 AMIGO2Q86SJ2 522 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 NLRP14Q86W24 1093 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 HPS6Q86YV9 775 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 TMTC1Q8IUR5 882 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF683Q8IZ20 524 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 APCDD1Q8J025 514 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 EID2Q8N6I1 236 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 NIPA2Q8N8Q9 360 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 OR6Y1Q8NGX8 325 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 MAPK15Q8TD08 544 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 DTX3LQ8TDB6 740 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 FAM172AQ8WUF8 416 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 C3orf49Q96BT1 292 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 PSKH2Q96QS6 385 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ADGRE3Q9BY15 652 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 GSDMCQ9BYG8 508 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ADNPQ9H2P0 1102 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC134Q9H6E4 229 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 SAYSD1Q9NPB0 183 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 SIX2Q9NPC8 291 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ABHD10Q9NUJ1 306 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 AIPL1Q9NZN9 384 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 TRPM6Q9BX84 2022 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 KALRNO60229 2985 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 PLXNA2O75051 1894 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 BPTFQ12830 3046 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa4.15□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 CACNA1GO43497 2377 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM131Q92545 1883 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 QSOX1O00391 747 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 TMPRSS11DO60235 418 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 PRAMEF11O60813 436 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 PALMO75781 387 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 TMCC1O94876 653 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 MT-ND3P03897 115 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 CD63P08962 238 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 CSF1P09603 554 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 NPSP0C0P6 89 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 LIPCP11150 499 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 NDUFB7P17568 137 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 WT1P19544 449 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 RRM1P23921 792 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 MMP12P39900 470 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 CETN2P41208 172 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGAP25P42331 645 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 MAPK9P45984 424 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 STK19P49842 368 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 AGTR2P50052 363 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 DNA2P51530 1060 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 SGSHP51688 502 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 DGKQP52824 942 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 POLE2P56282 527 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ARF5P84085 180 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 PDE1BQ01064 536 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 CFHR3Q02985 330 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 KLHL30Q0D2K2 578 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 SEC23BQ15437 767 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 DPYSL2Q16555 572 aa4.14□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 CAMK4Q16566 473 aa4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms