RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 MCUQ8NE86 351 aa16.05■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 PRAP1Q96NZ9 151 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 SERPINB12Q96P63 405 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 TAAR6Q96RI8 345 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 MKL2Q9ULH7 1088 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 CROCCQ5TZA2 2017 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 TRAV17A0A0B4J275 112 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 PCDH17O14917 1159 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 JRKO75564 520 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 UQCRHP07919 91 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 ITGAMP11215 1152 aa16.04■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 SLC1A2P43004 574 aa16.04■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 NDUFA9Q16795 377 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 HAS2Q92819 552 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 MS4A14Q96JA4 679 aa16.04■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa16.04■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 AVPR1BP47901 424 aa16.03■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 SHISA5Q8N114 240 aa16.03■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 OR9A4Q8NGU2 314 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 MACROD1Q9BQ69 325 aa16.03■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 C8orf89P0DMQ9 161 aa16.02■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 TDGF1P3P51864 188 aa16.02■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 KCNK10P57789 538 aa16.02■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 C1QL3Q5VWW1 255 aa16.02■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 SIGLEC10Q96LC7 697 aa16.02■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 IMMP1LQ96LU5 166 aa16.02■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 TUBB6Q9BUF5 446 aa16.02■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 TMEM184CQ9NVA4 438 aa16.02■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa16.02■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 ZGRF1Q86YA3 2104 aa16.01■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa16.01■□□□□ 0.15
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HERC3-211ENST00000513325 H0YIG0 161 aa16.01■□□□□ 0.15
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HERC3-211ENST00000513325 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 INAQ16352 499 aa16.01■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa16.01■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 MFSD4BQ5TF39 518 aa16.01■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 ABHD17BQ5VST6 288 aa16.01■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 PRSS41Q7RTY9 318 aa16.01■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 NAT8LQ8N9F0 302 aa16.01■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 VN1R1Q9GZP7 353 aa16.01■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 STMN3Q9NZ72 180 aa16.01■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa16.01■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 SH2B3Q9UQQ2 575 aa16.01■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 SVILO95425 2214 aa16■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa16■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
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